24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3230 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3230  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37780  hypothetical protein  95.28 
 
 
212 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000551578  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0808  hypothetical protein  44.39 
 
 
212 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2112  hypothetical protein  42.79 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.418722  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2028  hypothetical protein  42.79 
 
 
226 aa  151  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  37.62 
 
 
220 aa  134  7.000000000000001e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  35.65 
 
 
222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  33.01 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  34.87 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  33.67 
 
 
210 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  33.98 
 
 
218 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02150  hypothetical protein  37.38 
 
 
225 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  31.34 
 
 
212 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  30.41 
 
 
212 aa  99  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  30.58 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1279  protein of unknown function DUF218  30.29 
 
 
215 aa  92.8  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  34.19 
 
 
264 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  27.48 
 
 
189 aa  53.9  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  30.77 
 
 
205 aa  46.2  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  21.74 
 
 
199 aa  45.1  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  32.95 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  32.22 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  26.61 
 
 
193 aa  42.4  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0952  hypothetical protein  21.2 
 
 
199 aa  41.6  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>