42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2112 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2112  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  431  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.418722  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2028  hypothetical protein  99.53 
 
 		 226 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0808  hypothetical protein  83.33 
 
 		 212 aa  362  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  45.37 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  41.63 
 
 		 210 aa  171  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  43.2 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  41.86 
 
 		 222 aa  154  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  40.39 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  37.68 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3230  hypothetical protein  42.79 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37780  hypothetical protein  40.87 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000551578  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02150  hypothetical protein  41 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  41.21 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  41.41 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1279  protein of unknown function DUF218  36.87 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  35.18 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  31.25 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  32.59 
 
 		 264 aa  52.8  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  28.67 
 
 		 192 aa  49.3  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  35.87 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  32.11 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  32.11 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  25.14 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  29.6 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0901  protein of unknown function DUF218  25.35 
 
 		 266 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5542  hypothetical protein  28.49 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0952  hypothetical protein  24.58 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206967  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  31 
 
 		 273 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  27.52 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1295  protein of unknown function DUF218  30.67 
 
 		 254 aa  43.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  37.21 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  34 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  34 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1758  hypothetical protein  29.41 
 
 		 266 aa  42.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000726781 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  27.16 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  29.31 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1595  hypothetical protein  29.41 
 
 		 266 aa  42.4  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2231  protein of unknown function DUF218  29.41 
 
 		 266 aa  42.4  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0599192  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0710  protein of unknown function DUF218  34.78 
 
 		 393 aa  42  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  29.77 
 
 		 336 aa  41.2  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  29.58 
 
 		 213 aa  41.6  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>