33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2231 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2231  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 266 aa  551  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0599192  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1595  hypothetical protein  99.62 
 
 		 266 aa  550  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2020  hypothetical protein  99.25 
 
 		 266 aa  548  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193127 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1634  hypothetical protein  99.25 
 
 		 266 aa  548  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1758  hypothetical protein  99.25 
 
 		 266 aa  547  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000726781 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1497  hypothetical protein  98.87 
 
 		 266 aa  545  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01381  hypothetical protein  98.87 
 
 		 266 aa  545  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2244  hypothetical protein  98.87 
 
 		 266 aa  545  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01369  hypothetical protein  98.87 
 
 		 266 aa  545  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1760  protein YdcF  69.55 
 
 		 266 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1699  hypothetical protein  69.17 
 
 		 266 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  hitchhiker  0.00242518 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1516  protein YdcF  68.8 
 
 		 266 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1757  hypothetical protein  68.8 
 
 		 266 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal  0.0972712 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1820  hypothetical protein  68.8 
 
 		 266 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1952  hypothetical protein  63.53 
 
 		 264 aa  348  4e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1295  protein of unknown function DUF218  45.27 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01239  DUF218 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01750)  36.64 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0901  protein of unknown function DUF218  36.53 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1006  hypothetical protein  31.25 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0861939  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  27.98 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  31.82 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  26.05 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  25.93 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  27.44 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  35.16 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0808  hypothetical protein  31.72 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  25.52 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  22.58 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02150  hypothetical protein  28.37 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2028  hypothetical protein  29.17 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1279  protein of unknown function DUF218  32.91 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  25.9 
 
 		 224 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2112  hypothetical protein  29.41 
 
 		 211 aa  42.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.418722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>