35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1516 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1516  protein YdcF  100 
 
 
266 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1757  hypothetical protein  98.87 
 
 
266 aa  544  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal  0.0972712 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1699  hypothetical protein  99.25 
 
 
266 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  hitchhiker  0.00242518 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1760  protein YdcF  98.87 
 
 
266 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1820  hypothetical protein  98.12 
 
 
266 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01369  hypothetical protein  68.8 
 
 
266 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1758  hypothetical protein  68.42 
 
 
266 aa  394  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000726781 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2244  hypothetical protein  68.8 
 
 
266 aa  396  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1634  hypothetical protein  69.17 
 
 
266 aa  396  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1595  hypothetical protein  68.8 
 
 
266 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1497  hypothetical protein  68.8 
 
 
266 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2020  hypothetical protein  68.42 
 
 
266 aa  394  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193127 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01381  hypothetical protein  68.8 
 
 
266 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2231  protein of unknown function DUF218  68.8 
 
 
266 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0599192  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1952  hypothetical protein  61.65 
 
 
264 aa  334  7.999999999999999e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1295  protein of unknown function DUF218  40.82 
 
 
254 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01239  DUF218 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01750)  43.14 
 
 
270 aa  167  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191963  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0901  protein of unknown function DUF218  32.8 
 
 
266 aa  132  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1006  hypothetical protein  29.8 
 
 
264 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0861939  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  31.94 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  25.12 
 
 
212 aa  62.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  28.17 
 
 
215 aa  62.4  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  25.58 
 
 
212 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  26.73 
 
 
210 aa  60.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  26.36 
 
 
215 aa  57  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  29.32 
 
 
220 aa  49.7  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  28.41 
 
 
195 aa  45.8  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  30.25 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  32.18 
 
 
205 aa  43.9  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  26.62 
 
 
267 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  36.36 
 
 
224 aa  42.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  26.11 
 
 
237 aa  42.4  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  27.27 
 
 
253 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  29.69 
 
 
280 aa  42  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  32.18 
 
 
205 aa  42  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>