156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0426 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  100 
 
 
205 aa  423  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  98.54 
 
 
205 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  70.31 
 
 
206 aa  281  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  36.52 
 
 
190 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  36.91 
 
 
192 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2460  putative transmembrane protein  35.62 
 
 
185 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.919961  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  29.89 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  28.47 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  29.21 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  26.63 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  32.83 
 
 
279 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  30.41 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0952  hypothetical protein  26.44 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206967  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  36.07 
 
 
196 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  37.11 
 
 
219 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  26.76 
 
 
192 aa  61.6  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  29.61 
 
 
264 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  39.25 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  30.71 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  31.31 
 
 
196 aa  56.6  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  25.18 
 
 
195 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  33.63 
 
 
195 aa  55.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2200  hypothetical protein  37.5 
 
 
252 aa  55.8  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  26.09 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  31.01 
 
 
272 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  31.15 
 
 
212 aa  55.5  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  33.9 
 
 
235 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  28.26 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  25.55 
 
 
196 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  30.82 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  32.65 
 
 
251 aa  52.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  28.3 
 
 
256 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  30.71 
 
 
215 aa  52.4  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  32.39 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  28.46 
 
 
205 aa  52  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  28.1 
 
 
281 aa  52  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  28.46 
 
 
209 aa  52  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  32.29 
 
 
240 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  32.29 
 
 
240 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  36.9 
 
 
266 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  32.29 
 
 
240 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  32.29 
 
 
240 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  26.67 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  32.29 
 
 
240 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  31.4 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1279  protein of unknown function DUF218  24.02 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  27.53 
 
 
232 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  27.97 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  31.96 
 
 
301 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1032  protein of unknown function DUF218  39.68 
 
 
228 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  27.07 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  28.21 
 
 
196 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  28.18 
 
 
224 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  28.18 
 
 
224 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  28.46 
 
 
237 aa  49.7  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  28.39 
 
 
264 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  27.75 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  28.18 
 
 
260 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  27.5 
 
 
266 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  31.36 
 
 
205 aa  48.9  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  28.46 
 
 
237 aa  48.9  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  42.86 
 
 
206 aa  48.5  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5542  hypothetical protein  26.22 
 
 
195 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  30.89 
 
 
255 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  26.73 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  26.43 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  28.1 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  30.83 
 
 
199 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  21.64 
 
 
199 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  27.27 
 
 
251 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  25.83 
 
 
251 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  26.36 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  27.56 
 
 
255 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  27.56 
 
 
255 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  27.56 
 
 
255 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  27.56 
 
 
255 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  27.56 
 
 
255 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0884  hypothetical protein  31.87 
 
 
193 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150087  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  27.56 
 
 
255 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  27.56 
 
 
255 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  21.58 
 
 
199 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  28.93 
 
 
300 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  29.52 
 
 
260 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  31.91 
 
 
262 aa  47  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  30.38 
 
 
224 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  26.36 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  27.27 
 
 
245 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  26.36 
 
 
185 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  26.36 
 
 
185 aa  46.2  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  26.36 
 
 
185 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  29.9 
 
 
196 aa  46.2  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0878  hypothetical protein  30.77 
 
 
193 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  42.86 
 
 
206 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0895  hypothetical protein  30.77 
 
 
193 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  26.36 
 
 
185 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  27.27 
 
 
251 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  25.76 
 
 
185 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  28.05 
 
 
336 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  25.56 
 
 
178 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>