37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1820 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1820  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  547  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1760  protein YdcF  99.25 
 
 
266 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1757  hypothetical protein  99.25 
 
 
266 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal  0.0972712 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1699  hypothetical protein  98.87 
 
 
266 aa  540  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  hitchhiker  0.00242518 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1516  protein YdcF  98.12 
 
 
266 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2020  hypothetical protein  68.42 
 
 
266 aa  394  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193127 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1634  hypothetical protein  69.17 
 
 
266 aa  396  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2244  hypothetical protein  68.8 
 
 
266 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1595  hypothetical protein  68.8 
 
 
266 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1497  hypothetical protein  68.8 
 
 
266 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01381  hypothetical protein  68.8 
 
 
266 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01369  hypothetical protein  68.8 
 
 
266 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2231  protein of unknown function DUF218  68.8 
 
 
266 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0599192  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1758  hypothetical protein  68.42 
 
 
266 aa  393  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000726781 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1952  hypothetical protein  62.03 
 
 
264 aa  337  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1295  protein of unknown function DUF218  41.63 
 
 
254 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01239  DUF218 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01750)  43.14 
 
 
270 aa  166  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191963  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0901  protein of unknown function DUF218  31.98 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1006  hypothetical protein  29.8 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0861939  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  31.94 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  25.12 
 
 
212 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  26.29 
 
 
215 aa  62.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  25.58 
 
 
212 aa  62.4  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  26.27 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  26.36 
 
 
215 aa  56.6  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  30 
 
 
220 aa  48.5  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  27.27 
 
 
195 aa  46.2  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  25.29 
 
 
218 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  32.18 
 
 
205 aa  43.9  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  32.14 
 
 
206 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  26.62 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  25 
 
 
253 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  36.36 
 
 
224 aa  42.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  25.74 
 
 
237 aa  42.7  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  24.69 
 
 
251 aa  42.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  29.69 
 
 
280 aa  42.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  32.18 
 
 
205 aa  42  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>