298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1708 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  556  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  76.23 
 
 		 267 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  66.92 
 
 		 264 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  64.12 
 
 		 264 aa  338  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  65.27 
 
 		 264 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  64.89 
 
 		 264 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  49.24 
 
 		 281 aa  245  6e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  50.38 
 
 		 262 aa  238  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  47.35 
 
 		 265 aa  229  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  47.35 
 
 		 278 aa  228  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  48.11 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  44.27 
 
 		 267 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  47.62 
 
 		 275 aa  201  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  43.51 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  39.1 
 
 		 268 aa  189  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  38.72 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  43.18 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  41.85 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  40.23 
 
 		 266 aa  185  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  42.11 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  41.92 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  37.4 
 
 		 262 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  37.4 
 
 		 262 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  37.22 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  45.06 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  37.31 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  37.69 
 
 		 280 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  30.68 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0242  hypothetical protein  33.82 
 
 		 272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  31.15 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  32.82 
 
 		 266 aa  99  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  32.56 
 
 		 264 aa  98.6  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  24.71 
 
 		 254 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  33.64 
 
 		 252 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  30.12 
 
 		 259 aa  92.4  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  29.6 
 
 		 268 aa  92  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  31.3 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  29.1 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  26.27 
 
 		 251 aa  89.7  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  28.21 
 
 		 263 aa  88.6  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  33.46 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  29.96 
 
 		 258 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  27.99 
 
 		 256 aa  86.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  26.59 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  27.27 
 
 		 254 aa  85.9  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  29.44 
 
 		 282 aa  85.5  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  31.28 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  31.48 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  28.76 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  31.48 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  31.48 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  31.02 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  30.09 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  30.09 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  30.09 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  31.02 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  30.09 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  30.09 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  30.09 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  30.09 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  30.09 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  29.13 
 
 		 237 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  29.13 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  28.42 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  29.63 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  25.35 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  33.55 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  31.14 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  32.69 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  29.03 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  29.03 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  25 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  28.98 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  29.61 
 
 		 219 aa  75.5  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3249  hypothetical protein  40 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  32.37 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  30 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  32.18 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  32 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  29.44 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  33.2 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  30.88 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  29.35 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  28.24 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  25.1 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  31.36 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  28.17 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  33.57 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  30.92 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  33.21 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  27.13 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  30.77 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  27.76 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  33.53 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  23.66 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  29.61 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  31.28 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1526  hypothetical protein  30.88 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.107471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1498  hypothetical protein  30.88 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00465852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1488  hypothetical protein  30.88 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>