153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3249 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3249  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  407  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258971  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2964  hypothetical protein  85.53 
 
 
233 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0815547  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0884  hypothetical protein  72.55 
 
 
193 aa  228  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150087  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0878  hypothetical protein  71.9 
 
 
193 aa  227  8e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0895  hypothetical protein  71.9 
 
 
193 aa  227  8e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  43.75 
 
 
334 aa  94.7  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2069  protein of unknown function DUF218  45.24 
 
 
253 aa  90.9  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.325026  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1496  hypothetical protein  44.25 
 
 
375 aa  89  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1772  hypothetical protein  44.25 
 
 
375 aa  89  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000657641  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1601  hypothetical protein  44.25 
 
 
375 aa  89  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04767  hypothetical protein  38.36 
 
 
365 aa  88.2  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  38.14 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  33.7 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  30.51 
 
 
267 aa  68.6  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  32.89 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  35.61 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  32.54 
 
 
278 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  32.54 
 
 
265 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  31.5 
 
 
242 aa  61.6  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  31.06 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  35.58 
 
 
264 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  37.8 
 
 
270 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3404  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
170 aa  60.1  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  32.69 
 
 
284 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  32.68 
 
 
262 aa  59.7  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  33.91 
 
 
281 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  36.07 
 
 
237 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  36.44 
 
 
237 aa  58.9  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  35.58 
 
 
268 aa  58.2  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  32 
 
 
251 aa  58.2  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  33.96 
 
 
264 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  40.16 
 
 
337 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  35.58 
 
 
268 aa  57.4  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  31.78 
 
 
264 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  34.95 
 
 
266 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  33.08 
 
 
253 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  31.43 
 
 
262 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  33.14 
 
 
280 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  36.36 
 
 
273 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  35.16 
 
 
264 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  26.86 
 
 
256 aa  56.6  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  36.21 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  34.03 
 
 
252 aa  55.5  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  30.43 
 
 
280 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  32.69 
 
 
264 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0558  hypothetical protein  37.01 
 
 
153 aa  55.1  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1032  protein of unknown function DUF218  32.54 
 
 
228 aa  55.1  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3831  protein of unknown function DUF218  31.53 
 
 
232 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  30.4 
 
 
262 aa  54.7  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  29.81 
 
 
280 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3881  protein of unknown function DUF218  31.53 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.912065  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  29.52 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  31.3 
 
 
265 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  35.34 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  33.09 
 
 
258 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  24.43 
 
 
254 aa  52.4  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  32.33 
 
 
260 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  31.4 
 
 
256 aa  51.6  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  34.07 
 
 
265 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  36.84 
 
 
268 aa  51.6  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  29.06 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  38.82 
 
 
265 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  30 
 
 
267 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  27.66 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2404  hypothetical protein  28.07 
 
 
226 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0266202  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0930  protein of unknown function DUF218  30.43 
 
 
230 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  29.06 
 
 
185 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  29.14 
 
 
195 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  28.33 
 
 
185 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  37.21 
 
 
259 aa  48.9  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  33.66 
 
 
275 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  28.21 
 
 
185 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  48.5  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  25 
 
 
264 aa  48.9  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  28.33 
 
 
178 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  29.8 
 
 
336 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  31.03 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0901  protein of unknown function DUF218  32 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  36.73 
 
 
263 aa  46.6  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  40 
 
 
251 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3813  protein of unknown function DUF218  28.47 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  31.13 
 
 
224 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  31.36 
 
 
301 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2200  hypothetical protein  37.18 
 
 
252 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  33.1 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  32.95 
 
 
257 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  35.44 
 
 
257 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  30.32 
 
 
273 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  32.23 
 
 
268 aa  46.2  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  30.21 
 
 
282 aa  46.2  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  31.54 
 
 
271 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  29.69 
 
 
261 aa  46.2  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  31.62 
 
 
199 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  29.91 
 
 
185 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  34.25 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  29.7 
 
 
272 aa  45.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  34.25 
 
 
240 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  34.25 
 
 
240 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  34.25 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  34.25 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>