133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0901 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0901  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 201 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  38.55 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  34.96 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  31.66 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  29.3 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  36.59 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  34.96 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  34.96 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  30.72 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  34.21 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  31.68 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  31.37 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  32.48 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  32.48 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  32.48 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  32.48 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  32.48 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  32.48 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  32.48 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  32.48 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  32.69 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  31.4 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  32.93 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  31.15 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  27.39 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  28.28 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  29.45 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  28.04 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  28.04 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  39.22 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2372  hypothetical protein  30.63 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  29.03 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  32.34 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  31.68 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  26.97 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  30.97 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  28.82 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2048  hypothetical protein  28.75 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  29.11 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  28.82 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  35.25 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  28.82 
 
 		 344 aa  55.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  28.22 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  28.82 
 
 		 345 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  32.8 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07170  hypothetical protein  30 
 
 		 338 aa  55.1  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4938  hypothetical protein  28.24 
 
 		 344 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  28.24 
 
 		 345 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  26.09 
 
 		 342 aa  54.7  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  28.82 
 
 		 345 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  28.24 
 
 		 344 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  28.82 
 
 		 345 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  28.76 
 
 		 271 aa  53.9  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4919  hypothetical protein  28.82 
 
 		 344 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  28 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  26.92 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  26.28 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  27.08 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3664  hypothetical protein  31.15 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  30.14 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  30.77 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  25.32 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  31.68 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  30.08 
 
 		 185 aa  51.6  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  30.77 
 
 		 185 aa  51.2  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  30.77 
 
 		 185 aa  51.2  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  30.77 
 
 		 185 aa  51.2  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  30.77 
 
 		 185 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  28.37 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  30.17 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  29.91 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  25.77 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3216  protein of unknown function DUF218  26.86 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101173  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0710  protein of unknown function DUF218  35.29 
 
 		 393 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2008  hypothetical protein  28.68 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  28.37 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1839  hypothetical protein  33.6 
 
 		 373 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19840  hypothetical protein  35.48 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3467  hypothetical protein  27.65 
 
 		 345 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  28.76 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  26.4 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  29.91 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  32.05 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  29.93 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  28.95 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1680  hypothetical protein  30.33 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3433  hypothetical protein  30.43 
 
 		 230 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4935  hypothetical protein  30.43 
 
 		 230 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000188472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  35.77 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  26.22 
 
 		 256 aa  48.9  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1488  hypothetical protein  29.51 
 
 		 192 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5353  hypothetical protein  30.43 
 
 		 230 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00600694  normal  0.075763 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  29.51 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1526  hypothetical protein  29.51 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.107471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1645  hypothetical protein  29.51 
 
 		 172 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.840516  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  26.74 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1711  hypothetical protein  29.51 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>