189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0298 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  100 
 
 
230 aa  457  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1036  protein of unknown function DUF218  62.56 
 
 
248 aa  237  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2325  hypothetical protein  55.44 
 
 
270 aa  205  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6010  hypothetical protein  57.87 
 
 
226 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0036076  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0471  protein of unknown function DUF218  50.25 
 
 
216 aa  185  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  50.26 
 
 
225 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  50.27 
 
 
201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  47.85 
 
 
236 aa  172  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  45.41 
 
 
216 aa  164  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  41.62 
 
 
216 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3447  hypothetical protein  44.56 
 
 
233 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0430  hypothetical protein  36.68 
 
 
219 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  37.31 
 
 
219 aa  139  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3069  protein of unknown function DUF218  44.63 
 
 
231 aa  132  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000320027 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3517  hypothetical protein  38.89 
 
 
230 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743597  hitchhiker  0.000023852 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3483  SanA protein  38.89 
 
 
230 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3413  SanA protein  38.89 
 
 
210 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3579  SanA protein  38.89 
 
 
230 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.129921 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3409  SanA protein  38.89 
 
 
230 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1238  hypothetical protein  42.47 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.56645  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003738  SanA protein  41.38 
 
 
224 aa  124  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02033  hypothetical protein  41.24 
 
 
244 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  40 
 
 
189 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2008  hypothetical protein  39.51 
 
 
213 aa  123  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.456188 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02955  predicted thioredoxin-like protein  40.94 
 
 
230 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0615  protein of unknown function DUF218  40.94 
 
 
230 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.319627  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3378  putative SanA protein  40.35 
 
 
227 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.613446  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02905  hypothetical protein  40.94 
 
 
230 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0614  hypothetical protein  40.35 
 
 
227 aa  122  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4400  putative SanA protein  40.35 
 
 
230 aa  122  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801219  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3268  putative SanA protein  40.35 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3522  putative SanA protein  40.35 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3553  putative SanA protein  36.54 
 
 
227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322967  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1272  vancomycin resistance protein SanA  33.81 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.732001  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0807  sanA protein  38.82 
 
 
221 aa  116  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1706  protein of unknown function DUF218  39.64 
 
 
217 aa  108  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.080419  hitchhiker  1.73003e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  37.97 
 
 
223 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  41.6 
 
 
215 aa  105  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1077  SanA protein  29.17 
 
 
231 aa  105  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000060635  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2215  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
268 aa  105  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  41.67 
 
 
183 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2646  protein of unknown function DUF218  34.41 
 
 
201 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2226  protein of unknown function DUF218  31.28 
 
 
222 aa  101  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3100  protein of unknown function DUF218  40.62 
 
 
190 aa  101  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1566  hypothetical protein  34.62 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1943  hypothetical protein  33.69 
 
 
259 aa  98.6  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16005  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2403  hypothetical protein  33.8 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.655564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  35.47 
 
 
236 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  39.68 
 
 
212 aa  97.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2464  hypothetical protein  33.88 
 
 
245 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3021  hypothetical protein  33.88 
 
 
245 aa  96.7  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0104814 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2563  hypothetical protein  33.88 
 
 
245 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1672  hypothetical protein  34.91 
 
 
259 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.485835  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  42.62 
 
 
229 aa  95.9  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2330  hypothetical protein  33.16 
 
 
239 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2531  hypothetical protein  33.16 
 
 
239 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.379289  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2374  hypothetical protein  33.16 
 
 
239 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2423  hypothetical protein  33.16 
 
 
239 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2419  hypothetical protein  33.16 
 
 
239 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02073  hypothetical protein  32.46 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1514  protein of unknown function DUF218  32.46 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2304  hypothetical protein  34.62 
 
 
250 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02032  hypothetical protein  32.46 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2278  hypothetical protein  32.46 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2439  hypothetical protein  32.46 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3276  hypothetical protein  32.46 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.731411 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1504  hypothetical protein  32.46 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2291  hypothetical protein  32.46 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207497 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0827  hypothetical protein  32.63 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2747  hypothetical protein  31.94 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.608544  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2333  sanA protein, putative  28.5 
 
 
226 aa  90.1  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.182308  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  34.94 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  37.88 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  30.82 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  38.46 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  29.71 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  32.87 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  30 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  30 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  30 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  30 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  41.46 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  28.67 
 
 
185 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  35.44 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  28.48 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  32.34 
 
 
461 aa  69.7  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  37.5 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  28 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  29.27 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  29.27 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  37.6 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  29.93 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  28 
 
 
185 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  29.93 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  31.82 
 
 
345 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  36.21 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3433  hypothetical protein  32.26 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4935  hypothetical protein  32.26 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000188472 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5353  hypothetical protein  31.85 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00600694  normal  0.075763 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  33.33 
 
 
271 aa  63.2  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>