225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0022 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  676    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  57.14 
 
 
270 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  46.3 
 
 
280 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2048  hypothetical protein  38.7 
 
 
264 aa  191  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229439  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2372  hypothetical protein  38.13 
 
 
259 aa  185  9e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  40.89 
 
 
253 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  37.15 
 
 
267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  31.56 
 
 
262 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  35.14 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  31.01 
 
 
256 aa  116  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  35.2 
 
 
206 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  36.42 
 
 
206 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  33.55 
 
 
342 aa  95.1  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0832  hypothetical protein  31.12 
 
 
251 aa  93.2  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000170655  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  32.92 
 
 
257 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  32.92 
 
 
257 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  36.67 
 
 
271 aa  90.9  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  37.16 
 
 
322 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  37.16 
 
 
322 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  41.67 
 
 
336 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0710  protein of unknown function DUF218  36.81 
 
 
393 aa  90.1  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1488  hypothetical protein  36.6 
 
 
192 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1526  hypothetical protein  36.84 
 
 
192 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.107471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1498  hypothetical protein  36.84 
 
 
192 aa  87  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00465852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1645  hypothetical protein  36.84 
 
 
172 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.840516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1711  hypothetical protein  36.84 
 
 
192 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1680  hypothetical protein  35.29 
 
 
192 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  35.95 
 
 
192 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3664  hypothetical protein  29.95 
 
 
192 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98369  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  31.58 
 
 
185 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  33.55 
 
 
193 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  35.95 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1788  hypothetical protein  35.95 
 
 
159 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4938  hypothetical protein  33.99 
 
 
344 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3467  hypothetical protein  32.24 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4919  hypothetical protein  33.33 
 
 
344 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  33.11 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  32.68 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0069  protein of unknown function DUF218  38.67 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  32.68 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  32.68 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  32.68 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  32.68 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  32.68 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  32.68 
 
 
345 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0865  protein of unknown function DUF218  36.08 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.127642 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  32.24 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  34.93 
 
 
246 aa  77  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  31.58 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  31.58 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  31.58 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  31.58 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  33.55 
 
 
185 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0463  hypothetical protein  36.88 
 
 
178 aa  75.1  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  31.58 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  32.89 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  32.89 
 
 
185 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  30.34 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  34.33 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0901  protein of unknown function DUF218  31.66 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  31.39 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  38.06 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1950  hypothetical protein  31.85 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  29.61 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  26.25 
 
 
192 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0119  protein of unknown function DUF218  27.57 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422825  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  34.21 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0171  hypothetical protein  31.97 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04767  hypothetical protein  38.05 
 
 
365 aa  67  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  39.29 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  39.29 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  39.29 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07170  hypothetical protein  33.54 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  39.29 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  39.29 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  39.29 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  31.15 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1496  hypothetical protein  35.09 
 
 
375 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1601  hypothetical protein  35.09 
 
 
375 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1772  hypothetical protein  35.09 
 
 
375 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000657641  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  30.2 
 
 
188 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  29.14 
 
 
195 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  29.38 
 
 
236 aa  64.3  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1229  protein of unknown function DUF218  29.17 
 
 
378 aa  63.9  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  33.54 
 
 
266 aa  63.5  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  31.55 
 
 
268 aa  63.2  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  37.5 
 
 
280 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1032  protein of unknown function DUF218  35.66 
 
 
228 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  36.36 
 
 
237 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  36.76 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  35.29 
 
 
237 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  33.75 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  35.1 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  34.71 
 
 
181 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  33.75 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  26.98 
 
 
194 aa  60.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2069  protein of unknown function DUF218  36.72 
 
 
253 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.325026  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  34.09 
 
 
284 aa  60.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1839  hypothetical protein  26.58 
 
 
373 aa  60.5  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.07336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>