173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1950 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1950  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  643    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  50.35 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  50.35 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3467  hypothetical protein  37.16 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  33.84 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  33.47 
 
 		 344 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  37.3 
 
 		 345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  37.3 
 
 		 345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4938  hypothetical protein  36.76 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  33.46 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  36.76 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4919  hypothetical protein  36.22 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  39.35 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  36.76 
 
 		 345 aa  126  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  35.68 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0069  protein of unknown function DUF218  34.92 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  37.84 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1839  hypothetical protein  30.1 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0865  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.127642 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  40.4 
 
 		 256 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1229  protein of unknown function DUF218  33.88 
 
 		 378 aa  104  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  43.2 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  34.62 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1680  hypothetical protein  40.69 
 
 		 192 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  35.2 
 
 		 193 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  42.4 
 
 		 257 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0710  protein of unknown function DUF218  31.55 
 
 		 393 aa  102  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3664  hypothetical protein  40 
 
 		 192 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  34.42 
 
 		 206 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  33.14 
 
 		 262 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  34.57 
 
 		 194 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  36 
 
 		 192 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1526  hypothetical protein  36.75 
 
 		 192 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.107471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1498  hypothetical protein  36.75 
 
 		 192 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00465852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1488  hypothetical protein  37.74 
 
 		 192 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1645  hypothetical protein  37.74 
 
 		 172 aa  96.3  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.840516  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  28.74 
 
 		 258 aa  96.3  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  33.12 
 
 		 206 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1711  hypothetical protein  37.11 
 
 		 192 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1788  hypothetical protein  38.62 
 
 		 159 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  89.7  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0171  hypothetical protein  33.13 
 
 		 365 aa  87.4  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  33.75 
 
 		 246 aa  86.7  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0463  hypothetical protein  34.33 
 
 		 178 aa  86.7  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  31.85 
 
 		 185 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  38.03 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  34.29 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  31.85 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  31.85 
 
 		 185 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  31.85 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  32.08 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  31.85 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  31.85 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  32.48 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  31.85 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  31.85 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0832  hypothetical protein  31.91 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000170655  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1939  hypothetical protein  32.43 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  37.31 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07170  hypothetical protein  28.72 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2372  hypothetical protein  35.77 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1892  hypothetical protein  34.67 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  35.71 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2048  hypothetical protein  35.77 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  30.11 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0119  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422825  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  31.06 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  31.85 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  28.97 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  33.56 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  26.14 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  29.11 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  27.66 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  27.66 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  27.66 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  29.69 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  30.87 
 
 		 181 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  33.99 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  23.49 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  31.01 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  25.69 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1036  protein of unknown function DUF218  30.43 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  30.15 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  30 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  30.53 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0110  hypothetical protein  30.77 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  26.85 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  27.33 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  29.91 
 
 		 202 aa  57  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  28.68 
 
 		 208 aa  57  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  27.45 
 
 		 209 aa  57  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  26.57 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  28.93 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  23.49 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  31.5 
 
 		 223 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  28.57 
 
 		 210 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  28.93 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  24.24 
 
 		 182 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  24.24 
 
 		 182 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4935  hypothetical protein  26.75 
 
 		 230 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000188472 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>