90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2069 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2069  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 253 aa  497  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.325026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0895  hypothetical protein  47.62 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0878  hypothetical protein  47.62 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  33.03 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0884  hypothetical protein  47.62 
 
 		 193 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150087  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04767  hypothetical protein  34.63 
 
 		 365 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1772  hypothetical protein  30.7 
 
 		 375 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000657641  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1601  hypothetical protein  30.7 
 
 		 375 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1496  hypothetical protein  30.7 
 
 		 375 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2964  hypothetical protein  44.44 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0815547  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3249  hypothetical protein  45.24 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  32.92 
 
 		 346 aa  82  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  34.19 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  36.61 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  36.72 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  35.05 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  30.28 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  38.46 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  35.05 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0865  protein of unknown function DUF218  32.79 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.127642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  34.02 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  34.02 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  34.81 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0775  hypothetical protein, putative phage gene  26.46 
 
 		 337 aa  53.9  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.626314  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  29.22 
 
 		 301 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  30.47 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  31.01 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  30.47 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  30.25 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  31.97 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  37.11 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  31.06 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  31.96 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  36.03 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  31.62 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  31.78 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  31.9 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  31.25 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  31.9 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0242  hypothetical protein  33.33 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  31.25 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  34.82 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  28.77 
 
 		 240 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5353  hypothetical protein  28.57 
 
 		 230 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00600694  normal  0.075763 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  30.93 
 
 		 281 aa  48.9  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  28.77 
 
 		 240 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  28.77 
 
 		 240 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  28.77 
 
 		 240 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  28.77 
 
 		 240 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4935  hypothetical protein  28.57 
 
 		 230 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000188472 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  28.77 
 
 		 240 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3433  hypothetical protein  28.57 
 
 		 230 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  34.71 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  27.33 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  40.7 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  26.89 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  37.76 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  34.85 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  28.33 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  26.89 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  31.86 
 
 		 461 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  28.85 
 
 		 262 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  31.87 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  26.28 
 
 		 208 aa  46.6  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  27.27 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  33.98 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1032  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3100  protein of unknown function DUF218  35.04 
 
 		 190 aa  45.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  29.67 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3404  protein of unknown function DUF218  28.45 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  29.55 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  34.31 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  30.52 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  36.62 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  27.73 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  31.58 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  33.96 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  27.42 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  33.02 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  32.63 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  30.97 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  30.19 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  42.7  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  31.43 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1821  hypothetical protein  28.46 
 
 		 191 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.441586  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  27.78 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  30.16 
 
 		 252 aa  42  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  25.69 
 
 		 271 aa  42  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>