65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0775 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0775  hypothetical protein, putative phage gene  100 
 
 
337 aa  687    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.626314  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1496  hypothetical protein  30.3 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1772  hypothetical protein  30.3 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000657641  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1601  hypothetical protein  30.3 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  31.93 
 
 
253 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  27.74 
 
 
206 aa  53.9  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2069  protein of unknown function DUF218  25.7 
 
 
253 aa  53.9  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.325026  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  33.33 
 
 
246 aa  53.9  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  29.5 
 
 
264 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04767  hypothetical protein  31.16 
 
 
365 aa  53.1  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  29.37 
 
 
185 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  31.19 
 
 
185 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  31.19 
 
 
185 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  30.21 
 
 
258 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  31.19 
 
 
185 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  31.19 
 
 
185 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  28.68 
 
 
264 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  26.36 
 
 
223 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  28.68 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  31.78 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  31.19 
 
 
185 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  24.82 
 
 
270 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  28.68 
 
 
265 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  29.37 
 
 
185 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  25.97 
 
 
334 aa  50.1  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  31.19 
 
 
178 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  31.19 
 
 
185 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  26.47 
 
 
264 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  27.27 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  28.89 
 
 
267 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  31.09 
 
 
185 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  30.59 
 
 
215 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  31.78 
 
 
345 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  31.01 
 
 
345 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  29.9 
 
 
206 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  31.01 
 
 
344 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  27.34 
 
 
336 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  33.66 
 
 
235 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  34.02 
 
 
346 aa  46.2  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  25.86 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  26.92 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  30.23 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2734  hypothetical protein  29.91 
 
 
167 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  30.93 
 
 
206 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  31.76 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1032  protein of unknown function DUF218  31.19 
 
 
228 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  23.84 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  27.74 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3467  hypothetical protein  25.65 
 
 
345 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  25.19 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  26.95 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3249  hypothetical protein  28.32 
 
 
202 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258971  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4919  hypothetical protein  27.54 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  27.41 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  30.23 
 
 
345 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  30.23 
 
 
345 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0832  hypothetical protein  34.55 
 
 
251 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000170655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  29.93 
 
 
192 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31803  predicted protein  28.41 
 
 
228 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.36761 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  26.26 
 
 
247 aa  43.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  32.52 
 
 
256 aa  43.5  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3013  hypothetical protein  28.21 
 
 
198 aa  43.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4938  hypothetical protein  26.67 
 
 
344 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  26.32 
 
 
202 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  30.23 
 
 
268 aa  42.7  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>