18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3013 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_3013  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  400  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1588  hypothetical protein  27.64 
 
 
213 aa  48.1  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.103314 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  31.43 
 
 
244 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  30.48 
 
 
244 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  30.09 
 
 
207 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  29.52 
 
 
244 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36423  predicted protein  34.43 
 
 
334 aa  45.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  31.43 
 
 
244 aa  45.1  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3433  hypothetical protein  28.93 
 
 
230 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4935  hypothetical protein  28.93 
 
 
230 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000188472 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  30.25 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5353  hypothetical protein  28.93 
 
 
230 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00600694  normal  0.075763 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  27.83 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0775  hypothetical protein, putative phage gene  28.21 
 
 
337 aa  43.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.626314  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0049  protein of unknown function DUF218  31.4 
 
 
185 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.291592  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0069  protein of unknown function DUF218  31.3 
 
 
333 aa  42.4  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1950  hypothetical protein  24.35 
 
 
318 aa  41.6  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  29.52 
 
 
248 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>