174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1032 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1032  protein of unknown function DUF218  100 
 
 
228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  34.21 
 
 
206 aa  72  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  40.34 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3664  hypothetical protein  37.01 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98369  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1680  hypothetical protein  37.8 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  36 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  33.64 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  33.64 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  33.64 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  33.64 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  33.64 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  35.43 
 
 
194 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  34.65 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  32.73 
 
 
185 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  32.73 
 
 
185 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  32.73 
 
 
185 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  32.73 
 
 
192 aa  62.4  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  34.55 
 
 
185 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  32.73 
 
 
178 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  36.28 
 
 
256 aa  62  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  32.73 
 
 
185 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0884  hypothetical protein  36.28 
 
 
193 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150087  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  35.66 
 
 
337 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1788  hypothetical protein  35.43 
 
 
159 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  36.44 
 
 
271 aa  61.2  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0878  hypothetical protein  35.4 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0895  hypothetical protein  35.4 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0832  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000170655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1526  hypothetical protein  34.65 
 
 
192 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.107471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1498  hypothetical protein  34.65 
 
 
192 aa  59.7  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00465852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1488  hypothetical protein  34.65 
 
 
192 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1711  hypothetical protein  34.65 
 
 
192 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1645  hypothetical protein  34.65 
 
 
172 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.840516  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  33.61 
 
 
262 aa  58.9  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  29.25 
 
 
264 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  34.65 
 
 
192 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  39.24 
 
 
251 aa  58.5  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0463  hypothetical protein  34.55 
 
 
178 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2964  hypothetical protein  31.75 
 
 
233 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0815547  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  34.09 
 
 
246 aa  56.6  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  33.79 
 
 
199 aa  56.6  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  26.37 
 
 
254 aa  55.8  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  35.43 
 
 
336 aa  55.1  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  36.36 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  36.36 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  36.36 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  36.36 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  36.36 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  36.36 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3249  hypothetical protein  32.54 
 
 
202 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258971  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  35.9 
 
 
301 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  36.08 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1229  protein of unknown function DUF218  38.04 
 
 
378 aa  53.5  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  30 
 
 
344 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  31.62 
 
 
257 aa  52  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  33.67 
 
 
264 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  34.69 
 
 
264 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  31.54 
 
 
345 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  30 
 
 
345 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  35.35 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  32.61 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  30.77 
 
 
345 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  39.68 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  29.23 
 
 
345 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  38.84 
 
 
253 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  33.33 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  39.68 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  38.17 
 
 
253 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  33.33 
 
 
206 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  37.17 
 
 
280 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  29.23 
 
 
345 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  29.23 
 
 
344 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  31.82 
 
 
195 aa  50.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  29.23 
 
 
345 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  30.7 
 
 
461 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4938  hypothetical protein  29.23 
 
 
344 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  33.05 
 
 
334 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4919  hypothetical protein  29.23 
 
 
344 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2372  hypothetical protein  34.68 
 
 
259 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  35.06 
 
 
262 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  26.61 
 
 
346 aa  49.3  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  29.31 
 
 
243 aa  49.3  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0069  protein of unknown function DUF218  35.09 
 
 
333 aa  49.3  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  33.04 
 
 
322 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  33.04 
 
 
322 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  34.41 
 
 
262 aa  48.9  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  32.05 
 
 
281 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  30.3 
 
 
262 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  30.38 
 
 
214 aa  48.9  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1601  hypothetical protein  29.46 
 
 
375 aa  48.5  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  34.69 
 
 
280 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  32.41 
 
 
206 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1496  hypothetical protein  29.46 
 
 
375 aa  48.5  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1772  hypothetical protein  29.46 
 
 
375 aa  48.5  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000657641  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  34.96 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  30.3 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  30.3 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>