182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1123 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  497  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  92.89 
 
 
253 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  66.01 
 
 
253 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  66.8 
 
 
253 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  66.8 
 
 
253 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  67.59 
 
 
253 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  64.43 
 
 
256 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  65.22 
 
 
259 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  62.06 
 
 
256 aa  293  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  63.24 
 
 
256 aa  293  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  65.93 
 
 
253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  38.75 
 
 
251 aa  145  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  45.81 
 
 
259 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  38.15 
 
 
251 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  39.22 
 
 
230 aa  129  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  39.22 
 
 
271 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  41.28 
 
 
251 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  40.4 
 
 
262 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  44.85 
 
 
252 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  37.14 
 
 
247 aa  118  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  41.3 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  44.25 
 
 
215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  42.22 
 
 
259 aa  111  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  38.6 
 
 
255 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  36.44 
 
 
266 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  41.81 
 
 
247 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  29.25 
 
 
251 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  30.45 
 
 
261 aa  92.8  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  24.7 
 
 
242 aa  88.6  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  34.34 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  32.82 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  32.61 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  37.57 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  32.53 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  32.69 
 
 
260 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  29.55 
 
 
263 aa  79  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  32.56 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  32.99 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  31.6 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  32.47 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  27.87 
 
 
237 aa  72  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  27.87 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  31.96 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  31.54 
 
 
301 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  28.19 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  27.91 
 
 
282 aa  67  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  33.75 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  31.86 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  37.82 
 
 
280 aa  63.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  27.49 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  30.36 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2372  hypothetical protein  31.74 
 
 
259 aa  62.8  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  27.56 
 
 
256 aa  62.4  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  34.11 
 
 
248 aa  62.4  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  34.78 
 
 
267 aa  62  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  32.31 
 
 
284 aa  62  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  25.42 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  35.39 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  35.39 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  30.22 
 
 
273 aa  59.7  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  35.39 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  35.39 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  35.39 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  35.39 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  27.31 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  38.71 
 
 
262 aa  58.9  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  33.46 
 
 
250 aa  58.9  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  35.06 
 
 
252 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  30.61 
 
 
281 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  30.77 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  30.77 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  31.03 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0242  hypothetical protein  31.52 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  25.82 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2048  hypothetical protein  33.33 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229439  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  22.71 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  38.39 
 
 
195 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  30.41 
 
 
248 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  29.59 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  30.65 
 
 
246 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  32.62 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  31.09 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  25.78 
 
 
287 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  39.1 
 
 
336 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3336  hypothetical protein  40.23 
 
 
165 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  32.02 
 
 
268 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  30.73 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  31.18 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  30.29 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  29.95 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  36.84 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  28.69 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  28.69 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  28.69 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  28.69 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  28.69 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  28.69 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  28.69 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  28.14 
 
 
267 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  27.13 
 
 
253 aa  53.1  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>