More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2313 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  518  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  34.55 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  39.67 
 
 
237 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  39.67 
 
 
237 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  34.36 
 
 
263 aa  123  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  31.75 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  34.47 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  31.68 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  36.97 
 
 
265 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  36.97 
 
 
265 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  32.7 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  29.48 
 
 
256 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  33.81 
 
 
214 aa  111  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  33.6 
 
 
251 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  33.67 
 
 
252 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
262 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  27.67 
 
 
262 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  32.04 
 
 
235 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  31.85 
 
 
266 aa  101  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  31.85 
 
 
264 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  31.66 
 
 
260 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  32.71 
 
 
246 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  34.98 
 
 
272 aa  98.6  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  29.15 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  33.98 
 
 
244 aa  98.2  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  34.72 
 
 
280 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  28.51 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  34.72 
 
 
280 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  33.62 
 
 
236 aa  96.7  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  31.03 
 
 
251 aa  92.8  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  27.76 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  31.92 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  30.26 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  27.7 
 
 
215 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  30.29 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  31.82 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  29.27 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  29.2 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  26.27 
 
 
280 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  29.06 
 
 
272 aa  89  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  32.95 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  31.12 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  30.39 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  33.08 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  33.14 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  28.29 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  28.8 
 
 
268 aa  87.8  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  28.57 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  28.74 
 
 
253 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  29.13 
 
 
253 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  29 
 
 
253 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  29.13 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  26.8 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  32.68 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  37.01 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  27.8 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  26.91 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  27.41 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  30.36 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  31.41 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  32.39 
 
 
265 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  32.39 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  28.78 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  25.28 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  31.8 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  29.06 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  31.28 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  28.35 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  28.25 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  31.28 
 
 
219 aa  79  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  27.19 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  28.68 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  29.76 
 
 
281 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  27.35 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  27.35 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  30.09 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  27.35 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  27.35 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  27.35 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  27.35 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  27.35 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  28.14 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  29.77 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  29.41 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  30.36 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  28.65 
 
 
258 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  24.69 
 
 
265 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  29.05 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  28.97 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  26.77 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  26.34 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  28.16 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  26.51 
 
 
282 aa  72  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  26.06 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  26.34 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  25.29 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  25.71 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  29.59 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  31.89 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  29.26 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>