202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0162 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  484  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  65.26 
 
 
215 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  43.22 
 
 
251 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  51.1 
 
 
259 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  39.42 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  37.07 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  37.5 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  32.52 
 
 
242 aa  126  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  38.84 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  39.17 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  41 
 
 
252 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  45.56 
 
 
253 aa  118  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  40.24 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  39.41 
 
 
251 aa  116  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  39.84 
 
 
253 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  41.4 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  40.65 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  37.73 
 
 
259 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  38 
 
 
256 aa  111  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  43.24 
 
 
259 aa  108  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  41.71 
 
 
255 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  39.11 
 
 
266 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  39.11 
 
 
264 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  37.9 
 
 
253 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  36.65 
 
 
253 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  33.76 
 
 
265 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  38.68 
 
 
262 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  39.18 
 
 
252 aa  94.4  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  35.08 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  28.69 
 
 
251 aa  92  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  33.16 
 
 
214 aa  91.7  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  29.46 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  30.9 
 
 
237 aa  88.6  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  29.9 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  38.95 
 
 
271 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  30.9 
 
 
237 aa  87  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  30.21 
 
 
260 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  29.34 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  32.82 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  33.6 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  36.72 
 
 
266 aa  82  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  30 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  30.2 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  29.55 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  30.5 
 
 
262 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  26.72 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  32.81 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  34.2 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  31.56 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  28.81 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  30.74 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  32.02 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  32.6 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  29.36 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  30.32 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  29.09 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  26.95 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  31.38 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  30.16 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  28.4 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  27.73 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  30.32 
 
 
282 aa  65.5  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  29.27 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  29.36 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  30.08 
 
 
246 aa  63.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  29.39 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  31.37 
 
 
264 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  28.5 
 
 
287 aa  62.8  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  30.53 
 
 
262 aa  62.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  25.96 
 
 
236 aa  62.8  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  28.3 
 
 
246 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  31.88 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  33.05 
 
 
258 aa  59.7  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  31.06 
 
 
264 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  34.19 
 
 
249 aa  59.7  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0773  hypothetical protein  27.5 
 
 
300 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262461  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  30.06 
 
 
266 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  36.75 
 
 
280 aa  58.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  37.61 
 
 
280 aa  58.5  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  27.71 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  35.14 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  32.41 
 
 
334 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  29.68 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  31.02 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0947  hypothetical protein  31.37 
 
 
265 aa  57  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  29.48 
 
 
251 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1471  hypothetical protein  30.15 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  26.46 
 
 
272 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  32.22 
 
 
264 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  28.07 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  31.72 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  31.72 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  29.28 
 
 
259 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  24.29 
 
 
256 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  29.28 
 
 
259 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  32.41 
 
 
281 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>