239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1177 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  546  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  99.25 
 
 		 268 aa  541  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  74.68 
 
 		 235 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  48.09 
 
 		 266 aa  228  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  43.51 
 
 		 267 aa  202  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  43.02 
 
 		 262 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  42.37 
 
 		 264 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  40.84 
 
 		 264 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  44.54 
 
 		 265 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  44.54 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  39.1 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  40.98 
 
 		 278 aa  189  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  40.62 
 
 		 264 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  38.37 
 
 		 262 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  40.46 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  41.44 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  38.37 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  39.31 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  44.54 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  42.21 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  39.92 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  40.08 
 
 		 284 aa  169  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  47.55 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  37.55 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  40.54 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  37.84 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  41.21 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  31.09 
 
 		 242 aa  95.1  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  35.27 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  35.27 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  28.35 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  36.52 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  29.2 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0242  hypothetical protein  29.93 
 
 		 272 aa  89  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  27.95 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  30.19 
 
 		 260 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  30.77 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  27.86 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  32.39 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  32.74 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  37.79 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  32.74 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  33.68 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  27.27 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  29.71 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  27.38 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  29.05 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  34.42 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  26.79 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  30.77 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  32.46 
 
 		 250 aa  72  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  29.22 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  29.47 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  31.13 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  34.62 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  28.5 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  34.62 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  29.52 
 
 		 214 aa  68.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  32.98 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  29.15 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  33.97 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  33.97 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  33.97 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  33.85 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  34.34 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0878  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0895  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  28.77 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  28.63 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  37.01 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  27.98 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0884  hypothetical protein  36.54 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150087  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  32.8 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  32.11 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  31 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  27.46 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  27.46 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  27.46 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  31.55 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  29.05 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  29.89 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  34.36 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  32 
 
 		 346 aa  62  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  31.16 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  35.67 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  27.5 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  29.73 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  32.3 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  30.49 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  28.8 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  29.73 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  30.05 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0832  hypothetical protein  30.77 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000170655  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  28.1 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  31.28 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  27.2 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  28.81 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  27.33 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>