More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1119 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  479  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  99.58 
 
 
237 aa  476  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  39.67 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  35.29 
 
 
256 aa  138  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  37.04 
 
 
242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  35.09 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  35.83 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  32.94 
 
 
261 aa  105  8e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  30.52 
 
 
251 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  38.37 
 
 
214 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  34.65 
 
 
262 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  32.97 
 
 
250 aa  92  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  35.68 
 
 
251 aa  91.7  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  29.63 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  34.72 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  33.05 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  36.26 
 
 
252 aa  89  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  28.27 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  30.9 
 
 
247 aa  86.3  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  28.74 
 
 
263 aa  85.1  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  28.97 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  31.5 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  29.74 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  29.74 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  32.78 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  28.05 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  29.13 
 
 
280 aa  82  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  35.63 
 
 
262 aa  81.6  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  27.8 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  30.41 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  28.97 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  31.25 
 
 
258 aa  79  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  33.71 
 
 
259 aa  79  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  27.59 
 
 
263 aa  79  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  32.14 
 
 
264 aa  79  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  32.14 
 
 
266 aa  78.6  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  29.82 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  28.85 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  35.68 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  31.31 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  34.29 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  30.12 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  27.27 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  27.87 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  29.59 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  32.56 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  28.4 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  28.97 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  32.75 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  30.54 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  29.95 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  27.6 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  33.15 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  33.14 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  31.98 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  31.98 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  30.59 
 
 
251 aa  72  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  33.52 
 
 
253 aa  72  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  31 
 
 
262 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  29.96 
 
 
266 aa  72  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  30.71 
 
 
248 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  30.04 
 
 
281 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  32.35 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  31.82 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  29.05 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  25.84 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  31.43 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  38.39 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  27.17 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  36.99 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  26.59 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  30.46 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  31.52 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  29.58 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  31.52 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  31.52 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  31.49 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0884  hypothetical protein  40.17 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150087  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  31.52 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  31.52 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  31.52 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  32.58 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  31.52 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  31.52 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  31.52 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  30.81 
 
 
265 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  31.52 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  31.52 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  31.52 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  31.52 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  31.52 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  29.51 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  30.93 
 
 
262 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  27.76 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  31.4 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  31.52 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0878  hypothetical protein  39.32 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0895  hypothetical protein  39.32 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  33.16 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  29.55 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>