184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0547 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  495  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  41.37 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  41.3 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  41.2 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  45 
 
 		 259 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  40.62 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  40.73 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  43.86 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  40.08 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  41.34 
 
 		 253 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  42.11 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  45.56 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  32.67 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  38.52 
 
 		 271 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  42.03 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  39.61 
 
 		 253 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  39.61 
 
 		 253 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  40.44 
 
 		 256 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  41.06 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  38.89 
 
 		 266 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  38.89 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  38.94 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  39.73 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  32.23 
 
 		 242 aa  122  8e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  41 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  43.07 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  44.44 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  38.18 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  33.09 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  36.59 
 
 		 265 aa  99  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  33.47 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  33.47 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  32.02 
 
 		 251 aa  92.4  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  35.5 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  30.57 
 
 		 214 aa  89.7  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  28.74 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  31.66 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  34.51 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  32.44 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  30.93 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  31.62 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  29.85 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  36.23 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  32.87 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  29.55 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  32.68 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  32.43 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  32.68 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  30.77 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  30.34 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  35.23 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  32.58 
 
 		 262 aa  72  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  33.17 
 
 		 262 aa  72  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  30.94 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  31.47 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  48.31 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  28.17 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  33.78 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  40.66 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  35.91 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  30.71 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  29.23 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  34.12 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  30.08 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  29.65 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  30.83 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  31.84 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  29.2 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  29.91 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  35.65 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  33.65 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  30.09 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  31.52 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  32.17 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  27.95 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  33.15 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  28.8 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  38.89 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  31.4 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  30.35 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  31.77 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  27.96 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  39.58 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  30.65 
 
 		 250 aa  62  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  43.62 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  30.71 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  28.05 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  30.9 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  29.63 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  29.44 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  30.15 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  27.2 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  30.56 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  29.52 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  36.17 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  29.58 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  24.8 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  31.13 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  39.78 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>