191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6345 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  45.85 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  44.76 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  42.42 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  44.02 
 
 		 264 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  44.76 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  47.55 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  44.21 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  47.6 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  41.95 
 
 		 235 aa  165  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  45.28 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  49.76 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  45.85 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  47.06 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  45.96 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  42.64 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  45.34 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  45.49 
 
 		 264 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  41.34 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  44.16 
 
 		 281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  36.68 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  40.39 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  40 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  39.9 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  31.64 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  33.92 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  33.92 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  29.86 
 
 		 242 aa  93.2  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  32.42 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  33.69 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  33.69 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  32.62 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  32.62 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  32.62 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  33.97 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.13 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  32.09 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  32.09 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  32.09 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  32.09 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  32.09 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  32.09 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  32.09 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  32.09 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  32.2 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  31.55 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  35.66 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  30.26 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0242  hypothetical protein  31.18 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  35.48 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  32.6 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  26.61 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  34.8 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  26.61 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  29.21 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  29.44 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  32.62 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  30.54 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  30.94 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  31.82 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  27.23 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2964  hypothetical protein  37.37 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0815547  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  31.92 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  31.28 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  28.25 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  27.84 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  27.84 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  32.47 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  31.28 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  32.47 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  32.14 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  28.43 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  32.47 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  32.47 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  32.47 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  32.47 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  32.47 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  32.68 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  33.75 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0884  hypothetical protein  35.35 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150087  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  31.67 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  30.84 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0878  hypothetical protein  34.34 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0895  hypothetical protein  34.34 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  32.35 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  29.65 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  26.89 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  34.06 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  30.88 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  28.89 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  29.08 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  25.14 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  32.54 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  35.14 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  34.39 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2069  protein of unknown function DUF218  32.72 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.325026  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  39.26 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  24.38 
 
 		 251 aa  57  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3249  hypothetical protein  36.36 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>