245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1673 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  51.89 
 
 		 264 aa  255  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  45.45 
 
 		 262 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  41.85 
 
 		 280 aa  199  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  39.72 
 
 		 281 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  41.42 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  42.64 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  43.77 
 
 		 278 aa  189  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  43.02 
 
 		 265 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  43.02 
 
 		 278 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  41.2 
 
 		 264 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  38.81 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  40.82 
 
 		 267 aa  186  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  40.08 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  39.55 
 
 		 264 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  39.69 
 
 		 268 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  39.69 
 
 		 266 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  39.82 
 
 		 235 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  39.55 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  39.7 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  40.36 
 
 		 275 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  36.15 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  32.69 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  36.82 
 
 		 280 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  32.69 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  36.97 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  36.05 
 
 		 280 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  33.72 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  32.96 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  30.74 
 
 		 242 aa  95.1  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  30.59 
 
 		 282 aa  92.8  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  31.95 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  30.56 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  29.37 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  33.83 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  31.71 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  31.71 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  36.16 
 
 		 252 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  30.3 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  29.1 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  32.78 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  29.22 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  31.8 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  31.67 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  32.78 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  26.74 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0242  hypothetical protein  28.89 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  33.68 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  33.68 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  31.22 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  33.68 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  33.68 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  33.68 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  33.68 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  33.68 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  33.68 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  30.77 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  30.77 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  30.77 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  34.55 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  27.7 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  26.47 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  30.04 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  30.48 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  27.69 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  26.82 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  30 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  31.41 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  26.67 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  35.61 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  28.09 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  28.57 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  29.02 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  29.41 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  29.52 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  33.71 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  28.21 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1127  hypothetical protein  29.38 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  28.23 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  30 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  29.77 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  32.41 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  29.09 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  32.72 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  32.52 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  27 
 
 		 219 aa  68.9  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  27.75 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  29.63 
 
 		 230 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  32.58 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  36.5 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  30.11 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  29.34 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  27.17 
 
 		 287 aa  67  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  32.07 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  30.51 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  29.89 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  25.48 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  27 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  26.76 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>