188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2596 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  484  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  52.61 
 
 
251 aa  249  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  55.87 
 
 
248 aa  224  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  53.66 
 
 
250 aa  219  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  49.79 
 
 
251 aa  209  5e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  53.77 
 
 
246 aa  202  6e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  42.86 
 
 
249 aa  163  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  38.57 
 
 
236 aa  118  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  31.66 
 
 
262 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  32.06 
 
 
263 aa  111  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  30.47 
 
 
260 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  33.58 
 
 
263 aa  106  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  35.79 
 
 
265 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  35.79 
 
 
265 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  31.17 
 
 
237 aa  93.6  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  31.17 
 
 
237 aa  92.8  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  38.46 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  33.03 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  29.48 
 
 
260 aa  85.5  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  28.97 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  29.3 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  29.62 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  33.85 
 
 
268 aa  82  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  33.85 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  36.09 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  35.83 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  26.91 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  26.56 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  32.97 
 
 
267 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  34.08 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  34.07 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  35.56 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  33.71 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  33.85 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  27.41 
 
 
261 aa  68.6  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  32.43 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  32.04 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  32.07 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  28.68 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  31.69 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  31.02 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  32.48 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  30.55 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  29.83 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  29.85 
 
 
259 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  29.85 
 
 
259 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  27.64 
 
 
250 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  30.86 
 
 
259 aa  63.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  29.85 
 
 
259 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  28.52 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  29.85 
 
 
259 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  29.77 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  31.86 
 
 
253 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  29.85 
 
 
259 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  29.85 
 
 
259 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  29.85 
 
 
259 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  29.85 
 
 
259 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  30.68 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  27.8 
 
 
246 aa  62.8  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  29.03 
 
 
214 aa  62.8  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  31.85 
 
 
258 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  31.85 
 
 
258 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  28.83 
 
 
282 aa  62.4  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  31.85 
 
 
258 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  34.45 
 
 
267 aa  62.4  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  30.6 
 
 
264 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  41.3 
 
 
252 aa  62  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  31.85 
 
 
258 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  30.12 
 
 
251 aa  61.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  27.63 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  28.24 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  28.04 
 
 
282 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  29.21 
 
 
193 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  29.47 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  33.94 
 
 
262 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  31.35 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  29.69 
 
 
250 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  28.74 
 
 
250 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  26.07 
 
 
236 aa  59.7  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  26.14 
 
 
258 aa  59.7  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  27.13 
 
 
287 aa  58.9  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  32.74 
 
 
253 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  32.3 
 
 
253 aa  58.9  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  31.49 
 
 
272 aa  58.5  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  29.6 
 
 
213 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  37.1 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  30.73 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  29.5 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  32.17 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  30.65 
 
 
281 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  36.96 
 
 
264 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  30.05 
 
 
264 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  36.96 
 
 
266 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  37.65 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  31.14 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  27.22 
 
 
252 aa  56.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  29.05 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  30.38 
 
 
253 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  29.74 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.261557 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>