196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0761 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  100 
 
 
262 aa  511  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  45.05 
 
 
253 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  37.6 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  41.11 
 
 
256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  41.82 
 
 
259 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  40.61 
 
 
252 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  41.03 
 
 
256 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  42.79 
 
 
253 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  42.08 
 
 
253 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  41.2 
 
 
256 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  41.63 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  41.79 
 
 
253 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  41.79 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  41.43 
 
 
253 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  43.43 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  37.19 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  38.89 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  36.96 
 
 
264 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  42.53 
 
 
259 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  36.96 
 
 
266 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  27.67 
 
 
251 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  36.98 
 
 
251 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  27.8 
 
 
242 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  36.08 
 
 
237 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  36.08 
 
 
237 aa  102  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  37.02 
 
 
215 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  29.28 
 
 
256 aa  96.3  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  34.56 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  34.29 
 
 
230 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  34.02 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  32.46 
 
 
263 aa  90.5  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  30.94 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  37.58 
 
 
271 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  34.77 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  38.1 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  29.55 
 
 
251 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  34.22 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  30 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  29.57 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  31.42 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  34.3 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  30.39 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  26.39 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  31.79 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  34.3 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  30.26 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  34.5 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  28.1 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  31.36 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  32.77 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  30.12 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  30.73 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  31.25 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  32.05 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  35.43 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  35.11 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  29.6 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  31.89 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  31.61 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  29.15 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  34.1 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  31.49 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  32.14 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  30.68 
 
 
281 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  32.6 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  28 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  27.71 
 
 
256 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  42.55 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  32.68 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  31.06 
 
 
278 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  30.4 
 
 
267 aa  62.4  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  27.88 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  31.55 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  26.75 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  33.18 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  35.05 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  34.93 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  33.52 
 
 
268 aa  59.7  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  30.64 
 
 
225 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  28.33 
 
 
262 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  31.87 
 
 
279 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  26.42 
 
 
272 aa  58.9  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  26.45 
 
 
272 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  33.7 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  30.33 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  30.54 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  26.18 
 
 
268 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  30.77 
 
 
258 aa  56.2  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  29.35 
 
 
280 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  36.36 
 
 
252 aa  55.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  22.58 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  28.94 
 
 
253 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  28.36 
 
 
210 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  30.86 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  31.48 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  30.86 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  30.86 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  26.16 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  30.36 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>