208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0146 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 251 aa  510  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  75.7 
 
 		 251 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  75.3 
 
 		 266 aa  377  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  59.61 
 
 		 255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  59.61 
 
 		 255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  59.61 
 
 		 255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  59.61 
 
 		 255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  59.61 
 
 		 255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  59.61 
 
 		 255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  59.61 
 
 		 255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  58.04 
 
 		 255 aa  295  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  52.77 
 
 		 253 aa  230  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  38.98 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  39.38 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  39.92 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  40.44 
 
 		 224 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  40.44 
 
 		 224 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  36.59 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  39.01 
 
 		 224 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  38.57 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  36.75 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  35.47 
 
 		 258 aa  135  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0119  hypothetical protein  31.91 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420493  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1739  hypothetical protein  36.24 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  40.8 
 
 		 240 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  40.8 
 
 		 240 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  40.8 
 
 		 240 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  40.8 
 
 		 240 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  40.8 
 
 		 240 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  40.8 
 
 		 240 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  33.94 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  34.1 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0103  hypothetical protein  29.15 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0106  hypothetical protein  29.55 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  32.13 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  29.84 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  28.94 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  30.95 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  28.94 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  30.37 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  28.69 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  24.89 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  31.71 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  30.14 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  29.74 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  28.33 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  28.25 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  31.03 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  28.73 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  25 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  29.2 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  24.88 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  27.67 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  27.08 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  33.83 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  27.1 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  28.23 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  30.29 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  29.06 
 
 		 265 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  26.23 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  26.02 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  28.63 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  31.4 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  28.19 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  32.19 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  29.29 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  31.03 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  33.67 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  33.67 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  33.67 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  30.15 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  33.67 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  27.73 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  26.21 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  25.91 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  28.07 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  27.72 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  28.87 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  31.08 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  31.85 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  27.35 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  27.24 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  26.15 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  32.99 
 
 		 185 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  26.86 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  26.91 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  32.56 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  29.84 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  31.63 
 
 		 185 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  26.43 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  31.63 
 
 		 185 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  31.63 
 
 		 178 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  24.07 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  33.06 
 
 		 322 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  33.06 
 
 		 322 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  31.63 
 
 		 185 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  28.57 
 
 		 344 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  28.57 
 
 		 345 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  31.4 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  28.38 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>