160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4350 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  90.23 
 
 		 256 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  68.36 
 
 		 259 aa  321  8e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  61.26 
 
 		 256 aa  315  6e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  66.01 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  65.22 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  64.82 
 
 		 253 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  65.22 
 
 		 253 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  63.24 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  63.72 
 
 		 253 aa  287  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  62.85 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  38.68 
 
 		 251 aa  141  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  41.59 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  36.4 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  39.05 
 
 		 247 aa  129  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  41.92 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  37.83 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  40.98 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  46.1 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  35.57 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  42.29 
 
 		 247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  37.5 
 
 		 266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  38.31 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  40.57 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  37.01 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  40.72 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  34.98 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  27.82 
 
 		 242 aa  99.8  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  36.21 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  34.95 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  32.73 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  24.71 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  29.06 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  30.35 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  32.43 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  31.89 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  26.19 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  32.98 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  33.14 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  31.66 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  32.39 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  32.45 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  30.89 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2372  hypothetical protein  33.9 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  33.02 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  30.89 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2048  hypothetical protein  34.18 
 
 		 264 aa  62  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  28.52 
 
 		 263 aa  62  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  35.21 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  40.86 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  30.27 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  28.1 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  26.81 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  27.75 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  38.78 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  31.31 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  25.42 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  34.44 
 
 		 336 aa  58.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  26.48 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  51.79 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  31.35 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  27.51 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  50 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  28.65 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  50 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  28.26 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  26.44 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  29.21 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  29.55 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  34.3 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  38.64 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  31.65 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  37.62 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  44.64 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  32.41 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  33.14 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  30 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  32.53 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  29.95 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  28.11 
 
 		 272 aa  52.4  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  31.19 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  30.22 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  31.71 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  29.94 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  27.66 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  29.74 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3336  hypothetical protein  35.8 
 
 		 165 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  38.54 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  32.02 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  32.02 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  25.61 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  30.27 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  31.46 
 
 		 240 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  31.46 
 
 		 240 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  31.46 
 
 		 240 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  31.46 
 
 		 240 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  35 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  29.08 
 
 		 461 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  25.9 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>