103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2935 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  520  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  47.67 
 
 		 271 aa  188  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  46.67 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  45.75 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  38.37 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  38.46 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  38.84 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  39.47 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  35.8 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  34.18 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  36 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  37.5 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  35.86 
 
 		 253 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  37.44 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  37.62 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  33.06 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  36.86 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  38.12 
 
 		 253 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  37.13 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  33.05 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  31.53 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  34.02 
 
 		 262 aa  92.4  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  36.56 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  36.11 
 
 		 252 aa  89  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  37.89 
 
 		 215 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  36.05 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  32.5 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  32.5 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  27.15 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  27 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  25 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  25.52 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  31.36 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  26.62 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  36.22 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  24.25 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  36.22 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.61 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  34.09 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  35.71 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  24.56 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  24.89 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  30.48 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  26.98 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  30.22 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  28.22 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 		 244 aa  53.1  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  27.27 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2389  hypothetical protein  31.3 
 
 		 191 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  26.79 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  28.18 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  30.77 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0947  hypothetical protein  29.19 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  29.83 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1471  hypothetical protein  31.33 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  30.56 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  31.69 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  31.43 
 
 		 264 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  31.52 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  28.22 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  32.86 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  29.1 
 
 		 182 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  29.1 
 
 		 182 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  31.15 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  31.15 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0303  hypothetical protein  27.54 
 
 		 191 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  32.08 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  23.89 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  31.15 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  31.15 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  31.15 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  31.15 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  31.15 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  31.15 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  31.69 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  31.89 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  32.18 
 
 		 252 aa  46.2  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  28.34 
 
 		 254 aa  46.2  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  28.38 
 
 		 236 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  26.76 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  27.56 
 
 		 265 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  30.29 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  33.6 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  32.26 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  38.54 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  31.89 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  30.07 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  29.65 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  31.89 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  31.89 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  26.92 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  32.03 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  28.19 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  30.85 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  31.47 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  26.22 
 
 		 301 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  29.67 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  32.26 
 
 		 264 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  28.08 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  30.06 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>