33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0303 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0303  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2389  hypothetical protein  80.1 
 
 
191 aa  315  3e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26581  hypothetical protein  66.3 
 
 
213 aa  241  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01531  hypothetical protein  50 
 
 
194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1458  hypothetical protein  46.95 
 
 
188 aa  129  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0910474  normal  0.0228469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1821  hypothetical protein  40.11 
 
 
191 aa  121  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.441586  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3813  protein of unknown function DUF218  39.33 
 
 
194 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2734  hypothetical protein  41.29 
 
 
167 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1984  protein of unknown function DUF218  39.22 
 
 
200 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000111651  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1957  protein of unknown function DUF218  39.22 
 
 
200 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3502  hypothetical protein  42.07 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.420517  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4922  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  94.7  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354834  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3327  protein of unknown function DUF218  31.21 
 
 
202 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1037  hypothetical protein  33.77 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.689799  normal  0.109214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2404  hypothetical protein  31.51 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0266202  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0930  protein of unknown function DUF218  36.28 
 
 
230 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0298  hypothetical protein  33.79 
 
 
232 aa  68.2  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3831  protein of unknown function DUF218  33.09 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3881  protein of unknown function DUF218  33.09 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.912065  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2992  hypothetical protein  30 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.575665  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  36.96 
 
 
262 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  27.54 
 
 
266 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  32.28 
 
 
255 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  34.83 
 
 
252 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  27.4 
 
 
242 aa  44.3  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  29.46 
 
 
271 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  32.18 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  30.5 
 
 
264 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  29.2 
 
 
259 aa  42  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  34.83 
 
 
259 aa  41.6  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  35.64 
 
 
253 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  35.87 
 
 
253 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  35.87 
 
 
253 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>