37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1458 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1458  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0910474  normal  0.0228469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1821  hypothetical protein  56.65 
 
 		 191 aa  197  7.999999999999999e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.441586  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3813  protein of unknown function DUF218  53.37 
 
 		 194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1984  protein of unknown function DUF218  50.59 
 
 		 200 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000111651  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1957  protein of unknown function DUF218  50.59 
 
 		 200 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3502  hypothetical protein  52.12 
 
 		 176 aa  179  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.420517  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2734  hypothetical protein  51.61 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4922  hypothetical protein  47.02 
 
 		 198 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354834  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1037  hypothetical protein  44.81 
 
 		 188 aa  148  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.689799  normal  0.109214 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01531  hypothetical protein  41.67 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26581  hypothetical protein  44.1 
 
 		 213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0303  hypothetical protein  46.95 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2389  hypothetical protein  47.68 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3327  protein of unknown function DUF218  43.51 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0298  hypothetical protein  33.54 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2404  hypothetical protein  32.12 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0266202  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2992  hypothetical protein  31.58 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.575665  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0930  protein of unknown function DUF218  29.76 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3881  protein of unknown function DUF218  33.1 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.912065  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3831  protein of unknown function DUF218  33.1 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  31.43 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  34.78 
 
 		 251 aa  45.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  27.35 
 
 		 243 aa  45.1  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  28.85 
 
 		 262 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  27.52 
 
 		 262 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  28.87 
 
 		 280 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  35.61 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  29.32 
 
 		 238 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  26.26 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0483  protein of unknown function DUF218  31.65 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.470585 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  31.03 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3249  hypothetical protein  30.46 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  33.68 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  27.1 
 
 		 251 aa  42.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  26.12 
 
 		 242 aa  42.4  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  33.68 
 
 		 192 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 		 238 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0583825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>