26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3813 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3813  protein of unknown function DUF218  100 
 
 
194 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1984  protein of unknown function DUF218  65.82 
 
 
200 aa  268  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000111651  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1957  protein of unknown function DUF218  65.82 
 
 
200 aa  268  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3502  hypothetical protein  57.47 
 
 
176 aa  205  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.420517  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2734  hypothetical protein  57.86 
 
 
167 aa  198  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1821  hypothetical protein  57.5 
 
 
191 aa  187  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.441586  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1458  hypothetical protein  53.37 
 
 
188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0910474  normal  0.0228469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4922  hypothetical protein  44.37 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354834  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1037  hypothetical protein  47.3 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.689799  normal  0.109214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3327  protein of unknown function DUF218  44.52 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0303  hypothetical protein  39.33 
 
 
191 aa  119  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2389  hypothetical protein  43.66 
 
 
191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26581  hypothetical protein  38.92 
 
 
213 aa  111  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01531  hypothetical protein  39.75 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0298  hypothetical protein  34.68 
 
 
232 aa  94.4  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2992  hypothetical protein  32.8 
 
 
232 aa  85.9  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.575665  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2404  hypothetical protein  31.43 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0266202  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0930  protein of unknown function DUF218  35.21 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3881  protein of unknown function DUF218  35.71 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.912065  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3831  protein of unknown function DUF218  35.71 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3249  hypothetical protein  28.47 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258971  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  29.63 
 
 
262 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  32.35 
 
 
262 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  30.83 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  26.89 
 
 
206 aa  41.6  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  30.34 
 
 
259 aa  41.2  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>