45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0930 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0930  protein of unknown function DUF218  100 
 
 
230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3881  protein of unknown function DUF218  52.19 
 
 
232 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.912065  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3831  protein of unknown function DUF218  51.75 
 
 
232 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0298  hypothetical protein  50 
 
 
232 aa  205  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2404  hypothetical protein  46.19 
 
 
226 aa  189  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0266202  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2992  hypothetical protein  44.59 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.575665  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1957  protein of unknown function DUF218  34.1 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1984  protein of unknown function DUF218  34.1 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000111651  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3813  protein of unknown function DUF218  35.21 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2389  hypothetical protein  30.94 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1458  hypothetical protein  29.76 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0910474  normal  0.0228469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1821  hypothetical protein  33.56 
 
 
191 aa  72  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.441586  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0303  hypothetical protein  36.28 
 
 
191 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3502  hypothetical protein  35.33 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.420517  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4922  hypothetical protein  32.16 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354834  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2734  hypothetical protein  30.57 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26581  hypothetical protein  32.74 
 
 
213 aa  62  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3327  protein of unknown function DUF218  32.39 
 
 
202 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01531  hypothetical protein  26.8 
 
 
194 aa  58.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  33.88 
 
 
262 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3249  hypothetical protein  30.43 
 
 
202 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258971  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1037  hypothetical protein  27.32 
 
 
188 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.689799  normal  0.109214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2964  hypothetical protein  31.25 
 
 
233 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0815547  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  29.27 
 
 
253 aa  48.5  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0884  hypothetical protein  31.25 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150087  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  27.54 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0895  hypothetical protein  31.25 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0878  hypothetical protein  31.25 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  27.32 
 
 
346 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  26.61 
 
 
206 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  30.08 
 
 
256 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0463  hypothetical protein  29.03 
 
 
178 aa  44.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  32.22 
 
 
334 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  26.05 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  28.76 
 
 
192 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  22.46 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  25.81 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  25.9 
 
 
264 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  26.4 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  25.15 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  29.37 
 
 
280 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  28.03 
 
 
279 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  24.68 
 
 
253 aa  42  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  29.03 
 
 
256 aa  41.6  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1711  hypothetical protein  30.53 
 
 
192 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>