149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4809 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  90.23 
 
 		 256 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  67.97 
 
 		 259 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  61.26 
 
 		 256 aa  319  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  66.01 
 
 		 253 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  65.22 
 
 		 253 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  64.82 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  63.64 
 
 		 253 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  62.06 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  62.39 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  62.45 
 
 		 253 aa  285  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  37.45 
 
 		 251 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  40.27 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  35.22 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  38.1 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  37.39 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  41.15 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  37.19 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  42.29 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  43.51 
 
 		 252 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  41.05 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  34.9 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  39.43 
 
 		 215 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  36.57 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  36.05 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  27.71 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  38.92 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  34.57 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  41.14 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  25.88 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  35.29 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  31.34 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  29.6 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  33.71 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  31.84 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  31.01 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  32.26 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  31.01 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  31.72 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  32.95 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  23.69 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  32.11 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  27.98 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  32.02 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  29.49 
 
 		 263 aa  62  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  31.58 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  32.38 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2048  hypothetical protein  32.28 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2372  hypothetical protein  31.85 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  27.73 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  28.42 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  36.84 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  26.29 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  27.65 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  28.05 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  37.06 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  28.24 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  25.95 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  29.1 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  26.98 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  31.15 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  29.73 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  28.4 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  33.79 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  25.86 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  46.43 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  48.21 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  46.43 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  25.78 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  31.11 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  30.94 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  29.82 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  35.66 
 
 		 336 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  31.55 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  29.86 
 
 		 262 aa  52.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  31.33 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  29.84 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  33.88 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  33.58 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  37.14 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  29.07 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  27.66 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  30.51 
 
 		 240 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  32.95 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  30.51 
 
 		 240 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3336  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  49.3  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  36.08 
 
 		 224 aa  48.9  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  32.09 
 
 		 195 aa  49.3  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  26.84 
 
 		 255 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  26.84 
 
 		 255 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  29.79 
 
 		 461 aa  48.5  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  26.84 
 
 		 255 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  26.84 
 
 		 255 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  26.84 
 
 		 255 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  26.84 
 
 		 255 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  26.84 
 
 		 255 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  29.94 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  34.32 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  29.94 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>