167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0625 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 248 aa  486  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  49.17 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  55.87 
 
 		 250 aa  231  6e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  50 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  54.67 
 
 		 246 aa  221  6e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  49.8 
 
 		 250 aa  211  9e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  46.12 
 
 		 249 aa  168  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  37.34 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  31.15 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  33.5 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  32.55 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  30.41 
 
 		 265 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  30.41 
 
 		 265 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  27.76 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  27.76 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  33.97 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  33.71 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  28 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  41.67 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  27.27 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  31.4 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  29.18 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  28.51 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  25.78 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  32.05 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  31.86 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  31.86 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  31.86 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  31.86 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  33.49 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  30.3 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  28.84 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  31.37 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  30.08 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  28.1 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  34.36 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  33.47 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  33.48 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  35.61 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  33.82 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  34.36 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  33.82 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  33.49 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  30.88 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  38.66 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  34.46 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  39.45 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  31.79 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  28.24 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  27.19 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  26.74 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  39.45 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  34.27 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  33.11 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  31.51 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  29.77 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  34.22 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  29.68 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  31.98 
 
 		 275 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  35.14 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  28.43 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  28.43 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  28.43 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  28.43 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  28.43 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  28.43 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  28.43 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  28.43 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  28.43 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  34.51 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  29.5 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  35.45 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  39.78 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  30.53 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  41.18 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  28.21 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  30.54 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  29.96 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  26.27 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  35.26 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  27.85 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  30.59 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  31.78 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  33.93 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  30.9 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  26.22 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  30.9 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  30.27 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  28.26 
 
 		 287 aa  52.4  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  32.47 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  30.92 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  34.82 
 
 		 259 aa  52  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  29.17 
 
 		 256 aa  52  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  35.51 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  32.06 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  27.81 
 
 		 189 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  30.32 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  29.36 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  29.68 
 
 		 336 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>