129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2266 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  530  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  35.82 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  31.82 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  42.57 
 
 		 252 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  31.89 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  32.44 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  34.76 
 
 		 282 aa  118  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  30.77 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  32.35 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  34.92 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  34.02 
 
 		 282 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  27.56 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  33.6 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  34.6 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  34.6 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  34.6 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  34.6 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  33.97 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  33.97 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  33.97 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  33.97 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  33.97 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  33.97 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  33.97 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  33.97 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  34.12 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  33.97 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  27.51 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  29.06 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  28.85 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  29.12 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  29.71 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  31.2 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  31.4 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  31.54 
 
 		 250 aa  92.4  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  29.6 
 
 		 280 aa  92  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  30.15 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  27.61 
 
 		 252 aa  91.3  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  35 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  33.66 
 
 		 250 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  31.27 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  28.62 
 
 		 267 aa  89.7  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  29.04 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  32.23 
 
 		 262 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  29.6 
 
 		 244 aa  85.5  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  30.24 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  30.19 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  29.74 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  28.62 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  32.08 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  29.06 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  34.22 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  27.75 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  29.64 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  25.88 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1372  hypothetical protein  32.16 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651893  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  31.58 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  26.79 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  29.33 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  32.89 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  27.39 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  26.42 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  28.79 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  28 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  29.55 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  33.04 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  29.55 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  26.43 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2600  hypothetical protein  29.91 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  29.96 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  29.7 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  35.4 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  32 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  34 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  27.68 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  30.42 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  30.14 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  27.38 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  27.84 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  27.12 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  27.88 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  28.28 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  31.42 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  31.9 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  28.68 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2876  protein of unknown function DUF218  30.15 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380038  hitchhiker  0.0000392401 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  26.62 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  30.08 
 
 		 275 aa  62  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  34.73 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  30.65 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  26.62 
 
 		 237 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  30.4 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  28.65 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  25.84 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  26.79 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  29.28 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  29.15 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  31.82 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  33.55 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  26.32 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>