162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0242 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0242  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  559  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  35.66 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  33.7 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  33.7 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  32.25 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  35.16 
 
 		 264 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  30 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  29.74 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  33.09 
 
 		 272 aa  108  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  32.36 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  30.4 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  30.04 
 
 		 268 aa  105  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  31.97 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  30.88 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  31.87 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  32.6 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  31 
 
 		 265 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  32.73 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  32.59 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  32.49 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  29.78 
 
 		 264 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  33.48 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  28.25 
 
 		 256 aa  86.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  31.78 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  26.77 
 
 		 262 aa  85.5  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  26.94 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  31.62 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  26.94 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  27.6 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  30.22 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  29.6 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  24.54 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.33 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  26.17 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  25.18 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  29.58 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  25.44 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  26.07 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  29.96 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  25.94 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  29.76 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  29.67 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  25.91 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  25.61 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  28.87 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  28.65 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  24.8 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  23.68 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  28.86 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  24.07 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  23.66 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  25.68 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  23.61 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  26.92 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  23.53 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  27.84 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  26.88 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  27.98 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  32.43 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  27.6 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  28.64 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  24.24 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  27.84 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  25.52 
 
 		 282 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  32.43 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  29.03 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  25.35 
 
 		 248 aa  53.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  30.54 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  27.98 
 
 		 287 aa  52.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  25.86 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  25.86 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  26.09 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  25.86 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  26.69 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  25.86 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3664  hypothetical protein  25 
 
 		 192 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  25.86 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  25.86 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  25.86 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  25.86 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  25.86 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  24.56 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  25.54 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  26.4 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  39.13 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  23.99 
 
 		 248 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  26.97 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  24.54 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  26.09 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2069  protein of unknown function DUF218  33.04 
 
 		 253 aa  49.7  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.325026  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  27.63 
 
 		 256 aa  49.3  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1680  hypothetical protein  24.37 
 
 		 192 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  26.81 
 
 		 245 aa  48.9  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  25.42 
 
 		 264 aa  48.9  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  24.32 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>