104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0925 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  57.77 
 
 		 222 aa  265  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  44.12 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  42.65 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  43.72 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  40 
 
 		 218 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  40.89 
 
 		 212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  38.65 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1279  protein of unknown function DUF218  37.56 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2112  hypothetical protein  37.68 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.418722  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  35.1 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2028  hypothetical protein  37.68 
 
 		 226 aa  151  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0808  hypothetical protein  37.68 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02150  hypothetical protein  37.07 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37780  hypothetical protein  34.13 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000551578  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3230  hypothetical protein  33.01 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227113  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1699  hypothetical protein  28.17 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  hitchhiker  0.00242518 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1757  hypothetical protein  26.29 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal  0.0972712 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1760  protein YdcF  28.17 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1820  hypothetical protein  26.29 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  27.74 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1516  protein YdcF  28.17 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0901  protein of unknown function DUF218  26.11 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  27.52 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01369  hypothetical protein  25.93 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1497  hypothetical protein  25.93 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2244  hypothetical protein  25.93 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01381  hypothetical protein  25.93 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2231  protein of unknown function DUF218  25.93 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0599192  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2020  hypothetical protein  25.93 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193127 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1758  hypothetical protein  25.93 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000726781 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1634  hypothetical protein  25.93 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  34.96 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1595  hypothetical protein  25.46 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01239  DUF218 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01750)  23.35 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  30.08 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1952  hypothetical protein  24.42 
 
 		 264 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  30 
 
 		 265 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  26.32 
 
 		 264 aa  52  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  26.67 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  26.67 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  30.71 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  26.47 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  26.47 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  30 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  25.18 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0558  hypothetical protein  29.73 
 
 		 153 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  26.87 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  25.86 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  27.93 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  31.11 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1295  protein of unknown function DUF218  25.93 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  27.91 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  26.88 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  26.62 
 
 		 250 aa  48.5  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  29.94 
 
 		 260 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  24.43 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  27.61 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  28.68 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  25.78 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1588  hypothetical protein  26.15 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  30 
 
 		 278 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  30.48 
 
 		 263 aa  46.2  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  29.59 
 
 		 248 aa  45.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  27.74 
 
 		 262 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  25.35 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0952  hypothetical protein  24 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  32.26 
 
 		 251 aa  45.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  30 
 
 		 265 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  21.74 
 
 		 213 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  30 
 
 		 278 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  31.31 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  31.31 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  30.28 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  31.31 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  25.93 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  43.1 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  36.05 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  31.31 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0710  protein of unknown function DUF218  27.17 
 
 		 393 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  25.95 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  27.52 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  28.57 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  28.42 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  29.03 
 
 		 281 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  36.05 
 
 		 178 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  31.31 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  27.01 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5542  hypothetical protein  25.97 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  31.76 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  26.67 
 
 		 284 aa  42.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  31.67 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  30 
 
 		 267 aa  42.4  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  26.52 
 
 		 196 aa  42.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3467  hypothetical protein  33.33 
 
 		 345 aa  42.4  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  34.88 
 
 		 185 aa  42.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  29.32 
 
 		 250 aa  42.4  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  31.25 
 
 		 185 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  23.93 
 
 		 263 aa  42  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  34.07 
 
 		 322 aa  42  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>