101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2482 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  68.57 
 
 
224 aa  289  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1279  protein of unknown function DUF218  61.5 
 
 
215 aa  275  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02150  hypothetical protein  60.09 
 
 
225 aa  261  6.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  42.03 
 
 
222 aa  171  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  40 
 
 
215 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  45.81 
 
 
220 aa  170  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  41.09 
 
 
215 aa  156  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  37.25 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0808  hypothetical protein  42.64 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2112  hypothetical protein  41.41 
 
 
211 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.418722  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2028  hypothetical protein  41.62 
 
 
226 aa  143  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  36.27 
 
 
212 aa  135  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  35.96 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3230  hypothetical protein  33.98 
 
 
212 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37780  hypothetical protein  32.37 
 
 
212 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000551578  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3480  H+/gluconate symporter and related permease-like protein  33.81 
 
 
187 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.266773 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  25.99 
 
 
199 aa  62  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  35.94 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0952  hypothetical protein  25.42 
 
 
199 aa  59.3  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  29.69 
 
 
189 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  34.38 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  32.45 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  32.45 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  32.45 
 
 
210 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  29.85 
 
 
196 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1295  protein of unknown function DUF218  28 
 
 
254 aa  55.5  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  27.74 
 
 
264 aa  54.3  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  32.23 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  28.26 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  31.13 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  31.13 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  31.13 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  28.26 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  31.13 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  31.79 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  31.13 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5542  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  31.13 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  31.97 
 
 
249 aa  52.8  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2071  hypothetical protein  53.19 
 
 
401 aa  52  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  33.98 
 
 
251 aa  51.6  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2460  putative transmembrane protein  36.07 
 
 
185 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.919961  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  28.57 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  25.78 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  25.78 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  30.25 
 
 
196 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2020  hypothetical protein  23.04 
 
 
266 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193127 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  38.54 
 
 
250 aa  49.3  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  29.91 
 
 
182 aa  49.7  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  29.91 
 
 
182 aa  49.7  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1758  hypothetical protein  22.58 
 
 
266 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000726781 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0901  protein of unknown function DUF218  21.43 
 
 
266 aa  48.9  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  31.82 
 
 
193 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1595  hypothetical protein  22.58 
 
 
266 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  27.91 
 
 
199 aa  48.5  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2231  protein of unknown function DUF218  22.58 
 
 
266 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0599192  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01239  DUF218 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01750)  28.48 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191963  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01369  hypothetical protein  22.58 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  29.29 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1497  hypothetical protein  22.58 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2244  hypothetical protein  22.58 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01381  hypothetical protein  22.58 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  27.97 
 
 
196 aa  47  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  27.41 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1634  hypothetical protein  22.12 
 
 
266 aa  46.6  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  29.82 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1006  hypothetical protein  21.05 
 
 
264 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0861939  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  31.82 
 
 
194 aa  46.2  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  29.46 
 
 
210 aa  46.2  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
199 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  36.49 
 
 
237 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  29.2 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  24.43 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  23.19 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1820  hypothetical protein  25.29 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  25.44 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  35.48 
 
 
344 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  35.48 
 
 
345 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  36.49 
 
 
237 aa  43.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  36.17 
 
 
273 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  30 
 
 
185 aa  42.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3467  hypothetical protein  33.87 
 
 
345 aa  42.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  35.48 
 
 
344 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  33.78 
 
 
284 aa  42.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  35.38 
 
 
345 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  35.48 
 
 
345 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  35.48 
 
 
345 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  35.48 
 
 
345 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4938  hypothetical protein  35.48 
 
 
344 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  28.92 
 
 
243 aa  42.4  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  32.98 
 
 
252 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 
248 aa  42.4  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4919  hypothetical protein  35.48 
 
 
344 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  29.47 
 
 
246 aa  42  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  26.45 
 
 
196 aa  42  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1760  protein YdcF  25.45 
 
 
266 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  35.48 
 
 
345 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  26.36 
 
 
195 aa  42  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>