110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2729 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 192 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  92.11 
 
 		 190 aa  353  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2460  putative transmembrane protein  82.07 
 
 		 185 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.919961  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  34.68 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  35.56 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  34.1 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  43.4 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  32.91 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  33.54 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  29.63 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  40 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  33.61 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  27.65 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  35.96 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  35.94 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  34.78 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  35.78 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  30.61 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  30.61 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  30.53 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  30.15 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  32.53 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  31.03 
 
 		 266 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  27.59 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  34.71 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  29.94 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2200  hypothetical protein  32.58 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  27.59 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  31.58 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1279  protein of unknown function DUF218  31.15 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  35.96 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  31.08 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  33.94 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  31.82 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  34.78 
 
 		 280 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  27.8 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  33.09 
 
 		 262 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  28.72 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  36.52 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  32.71 
 
 		 262 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  31.78 
 
 		 251 aa  52  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 264 aa  52  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  31.19 
 
 		 262 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  35.29 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  29.29 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  26.14 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  30.06 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  27.56 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  32.33 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  32.48 
 
 		 200 aa  48.5  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  27.91 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  32.54 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  28.24 
 
 		 238 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02150  hypothetical protein  32.87 
 
 		 225 aa  48.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  31.75 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  28.83 
 
 		 254 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2846  hypothetical protein  32.74 
 
 		 280 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  31.51 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  32.26 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  38.3 
 
 		 334 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  29.27 
 
 		 272 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  28.33 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  29.29 
 
 		 262 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  33.65 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  31.15 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  26.61 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  34.86 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  29.87 
 
 		 284 aa  45.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  28.46 
 
 		 242 aa  46.2  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  33.61 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  34.29 
 
 		 301 aa  45.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  26.32 
 
 		 249 aa  45.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3327  protein of unknown function DUF218  32.67 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3433  hypothetical protein  30.51 
 
 		 230 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4935  hypothetical protein  30.51 
 
 		 230 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000188472 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5353  hypothetical protein  30.51 
 
 		 230 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00600694  normal  0.075763 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  31.93 
 
 		 211 aa  44.7  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  30 
 
 		 219 aa  44.7  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  24.03 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  27.91 
 
 		 262 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1496  hypothetical protein  34.33 
 
 		 375 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  24.67 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1772  hypothetical protein  34.33 
 
 		 375 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000657641  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1601  hypothetical protein  34.33 
 
 		 375 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  31.71 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  34.96 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  29.92 
 
 		 250 aa  43.9  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  29.7 
 
 		 273 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  32.28 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1708  hypothetical protein  35.34 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  34.29 
 
 		 240 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  26.62 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  34.29 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  30.51 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  34.29 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  34.29 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  28.76 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  29.37 
 
 		 264 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>