136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4260 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  382  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  71.96 
 
 		 213 aa  278  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  31.91 
 
 		 205 aa  84.3  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  33.1 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  33.1 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  29.7 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  32.95 
 
 		 228 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  28.57 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  35.29 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  29.19 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  37.06 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  30.06 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  32.14 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  29.63 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  30.06 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  30.92 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  30.06 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  30.41 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  30.41 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  31.91 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  28.75 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  26.44 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  27.83 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  28.38 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  37.76 
 
 		 249 aa  61.6  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  29.21 
 
 		 250 aa  61.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  28.83 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  28.83 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  28.83 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  35.29 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  36.15 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  28.83 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  28.83 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0483  hypothetical protein  36.59 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  32.53 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  35.29 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  29.37 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  30.11 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  31.03 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  27.54 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  27.69 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  28.22 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  34.16 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  28 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  29.22 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  27.67 
 
 		 461 aa  57.8  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  30.53 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1127  hypothetical protein  32.61 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  30.43 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  32.34 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  32.75 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2460  putative transmembrane protein  33.72 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.919961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  27.59 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  30.77 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0746  protein of unknown function DUF218  28.67 
 
 		 370 aa  55.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  25 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  34.51 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  28.73 
 
 		 250 aa  54.7  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  25.13 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  24.39 
 
 		 237 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  30.53 
 
 		 246 aa  53.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  28.95 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  24.39 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  24.39 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  29.34 
 
 		 282 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1708  hypothetical protein  37.27 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  29.66 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  29.88 
 
 		 282 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  33.59 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  32.26 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3216  protein of unknown function DUF218  27.61 
 
 		 244 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101173  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  29.17 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  36.08 
 
 		 259 aa  51.6  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  27.15 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  28.47 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  28.19 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  28.23 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  25.6 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  24.79 
 
 		 242 aa  49.7  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  28.74 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  25.6 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  28.97 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1272  protein of unknown function DUF218  31.65 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  26.25 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  33.11 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  31.82 
 
 		 218 aa  48.5  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  38.24 
 
 		 282 aa  48.5  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  25 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  35.34 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  26.9 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  28.33 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  30.4 
 
 		 258 aa  48.1  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  37.07 
 
 		 336 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  25.78 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  30.83 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  25.32 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  27.03 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  23.81 
 
 		 265 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0692  hypothetical protein  29.48 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0213382  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  26.83 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>