26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_37780 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_37780  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000551578  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3230  hypothetical protein  95.28 
 
 
212 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227113  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0808  hypothetical protein  43.2 
 
 
212 aa  161  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2112  hypothetical protein  40.87 
 
 
211 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.418722  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2028  hypothetical protein  40.87 
 
 
226 aa  149  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  36.1 
 
 
220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  37.16 
 
 
222 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  36 
 
 
215 aa  124  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  34.13 
 
 
215 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  34.67 
 
 
210 aa  112  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  31.84 
 
 
212 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  30.65 
 
 
212 aa  101  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  32.37 
 
 
218 aa  101  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02150  hypothetical protein  34.78 
 
 
225 aa  101  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  31.55 
 
 
224 aa  97.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1279  protein of unknown function DUF218  29.47 
 
 
215 aa  92  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  36.11 
 
 
264 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  27.48 
 
 
189 aa  52.4  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  45.1  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  31.3 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  22.28 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  41.6  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  41.6  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  41.6  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>