48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1089 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0952  hypothetical protein  99.5 
 
 		 199 aa  403  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  39.79 
 
 		 189 aa  135  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  34.97 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3480  H+/gluconate symporter and related permease-like protein  27.57 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266773 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  28.47 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  28.47 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  26.94 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  26.82 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  33.58 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  29.2 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  25.99 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5542  hypothetical protein  25.7 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  28.85 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  23.2 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  27.86 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  23.2 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02150  hypothetical protein  27.54 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  27.42 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  24.48 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1279  protein of unknown function DUF218  26.98 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  25.19 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  37.31 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  31.58 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  24.43 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1711  protein of unknown function DUF218  21.94 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.725568  hitchhiker  0.00117492 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0808  hypothetical protein  25.29 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  42.62 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  30.56 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2112  hypothetical protein  25.14 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.418722  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  27.18 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2028  hypothetical protein  27.34 
 
 		 226 aa  45.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  42.62 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  31.11 
 
 		 257 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3230  hypothetical protein  21.74 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227113  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  26.53 
 
 		 264 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  24.29 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37780  hypothetical protein  22.28 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000551578  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  31.76 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  31.76 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3516  hypothetical protein  24.26 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3213  group-specific protein  24.26 
 
 		 183 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  38.1 
 
 		 252 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3269  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  42  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.106822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3299  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.23381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  38.71 
 
 		 345 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3559  hypothetical protein  25 
 
 		 225 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  38.71 
 
 		 345 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>