125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2396 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  403  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  69.59 
 
 		 198 aa  286  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  65.79 
 
 		 199 aa  268  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  62.12 
 
 		 199 aa  268  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  63.92 
 
 		 196 aa  265  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  63.68 
 
 		 200 aa  262  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  62.89 
 
 		 195 aa  260  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  35.64 
 
 		 221 aa  95.1  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  38.78 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  35.37 
 
 		 300 aa  92.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  34.22 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  33.7 
 
 		 241 aa  89.4  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  32.09 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  34.52 
 
 		 238 aa  88.6  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  37.66 
 
 		 240 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  31.49 
 
 		 302 aa  87.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  34.87 
 
 		 245 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  33.9 
 
 		 241 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  34.59 
 
 		 218 aa  85.1  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  33.13 
 
 		 245 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  30.39 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  32.57 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  30.39 
 
 		 300 aa  81.3  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  31.47 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  34.18 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  32.17 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  32.24 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  31.47 
 
 		 283 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  30 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  30.57 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  30.94 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  27.53 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  30.56 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  29.32 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  30.46 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  28.95 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  28.95 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  30.41 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  37.19 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3480  H+/gluconate symporter and related permease-like protein  36.56 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266773 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  28.89 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  22.07 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  23.96 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  25.86 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  25.27 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  23.24 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  30.2 
 
 		 251 aa  50.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  26.26 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  29.73 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  33.06 
 
 		 284 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  29.29 
 
 		 251 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  21 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  41.54 
 
 		 268 aa  48.9  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  29.3 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  22.75 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  29.45 
 
 		 252 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  22.75 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  31.58 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  25 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  27.89 
 
 		 222 aa  48.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  25 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0952  hypothetical protein  31.58 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  22.75 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  22.75 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  21.29 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  40.98 
 
 		 262 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  24.75 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  34.57 
 
 		 264 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  22.22 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  22.22 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  37.33 
 
 		 280 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  37.31 
 
 		 280 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  22.22 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  29.06 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  33.85 
 
 		 251 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  22.22 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  28.21 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  40.98 
 
 		 264 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  22.22 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  30.66 
 
 		 262 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  31.91 
 
 		 250 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  38.33 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  24.44 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  39.22 
 
 		 346 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  28.22 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  25.6 
 
 		 235 aa  45.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  32.76 
 
 		 262 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  35.8 
 
 		 281 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  31.67 
 
 		 262 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  40 
 
 		 278 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  34.55 
 
 		 242 aa  44.7  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  29.45 
 
 		 259 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  29.91 
 
 		 268 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  31.82 
 
 		 280 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  38.46 
 
 		 265 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  22.45 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  37.68 
 
 		 267 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  36.92 
 
 		 267 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  38.46 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  32.28 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>