42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2890 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  352  1e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  53.98 
 
 		 182 aa  193  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  53.11 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  39.01 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  36.73 
 
 		 202 aa  100  7e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  39.2 
 
 		 241 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  38.42 
 
 		 232 aa  99  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  38.59 
 
 		 246 aa  98.6  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  41.06 
 
 		 300 aa  98.2  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  42.75 
 
 		 238 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  39.01 
 
 		 208 aa  97.1  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  44.19 
 
 		 238 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  34.27 
 
 		 221 aa  91.7  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  37.22 
 
 		 241 aa  91.3  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  32.76 
 
 		 207 aa  91.3  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  38 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  36.18 
 
 		 240 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  33.91 
 
 		 302 aa  86.3  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  37.91 
 
 		 241 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  35.98 
 
 		 240 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  33.53 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  39.26 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  41.48 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  33.88 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  32.89 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  30.73 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  30.73 
 
 		 300 aa  71.6  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  37.76 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  32.14 
 
 		 234 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  33.93 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  32.14 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  29.51 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  28.96 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  30.61 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  29.41 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  28 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  28.47 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  30.83 
 
 		 235 aa  45.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  32 
 
 		 225 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  31.39 
 
 		 196 aa  44.3  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0764  hypothetical protein  29.82 
 
 		 212 aa  41.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0330031 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>