46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3091 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  98.72 
 
 		 283 aa  463  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  88.03 
 
 		 234 aa  388  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  68.12 
 
 		 258 aa  297  8e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  67.4 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  67.84 
 
 		 245 aa  277  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  43.91 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  43.04 
 
 		 240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  42.6 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  46.27 
 
 		 300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  45.26 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  46.11 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  44.5 
 
 		 221 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  45.45 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  46.5 
 
 		 246 aa  157  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  43.24 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  43.72 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  42.19 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  41.12 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  39.13 
 
 		 218 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  43.43 
 
 		 207 aa  141  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  40.53 
 
 		 300 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  40.53 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  40.74 
 
 		 302 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  39.13 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  35.26 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  34.38 
 
 		 195 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  36.53 
 
 		 218 aa  90.1  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  29.51 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  37.25 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  28.42 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  35.76 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  32.24 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  31.03 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  28.22 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  29.28 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  29.7 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  31.93 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  28.64 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  29.01 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  29.78 
 
 		 268 aa  48.9  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  29.17 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  29.08 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  35.19 
 
 		 251 aa  42  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  25.17 
 
 		 262 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>