40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3070 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 213 aa  421  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  39.71 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  43.1 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  39.3 
 
 		 238 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  39.46 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  40.11 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  40.46 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  37.38 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  41.77 
 
 		 195 aa  108  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  36.71 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  39.33 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  35.8 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  36.36 
 
 		 300 aa  99.4  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  36.7 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  36.76 
 
 		 240 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  38.62 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  39.43 
 
 		 300 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  33.86 
 
 		 302 aa  95.1  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  37.56 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  36.46 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  34.95 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  41.06 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  38.73 
 
 		 238 aa  89  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  38.37 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  35.79 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  34.54 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  38.16 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  39.35 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  37.42 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  36.36 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  30.52 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  38.97 
 
 		 176 aa  74.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  30.46 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  28.48 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  27.81 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  30.46 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  27.92 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  31.82 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  25.13 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  30.84 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>