63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3082 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  38.74 
 
 		 218 aa  121  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  42.94 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  39.11 
 
 		 207 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  39.46 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  108  6e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  35.83 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  39.11 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  37.63 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  37.27 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  36.65 
 
 		 221 aa  101  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  40 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  36.36 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  34.8 
 
 		 246 aa  98.2  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  35.06 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  38.31 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  36.21 
 
 		 241 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  32.86 
 
 		 238 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  37.02 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  35.1 
 
 		 258 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  34.2 
 
 		 300 aa  92  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  34.2 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  36.81 
 
 		 234 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  32.12 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  36.53 
 
 		 283 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  37.57 
 
 		 176 aa  89  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  34.91 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  36.42 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  30.85 
 
 		 302 aa  85.9  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  36.13 
 
 		 234 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  32.74 
 
 		 182 aa  84.7  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  36.84 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  26.74 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  27.13 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  25.67 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  30.86 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  27.13 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  26.67 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  29.73 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  32.79 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1708  hypothetical protein  37.27 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  25 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  26.84 
 
 		 272 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  38.53 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  32.26 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3480  H+/gluconate symporter and related permease-like protein  28.89 
 
 		 187 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266773 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  29.34 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  29.86 
 
 		 246 aa  45.4  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  27.86 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1739  hypothetical protein  47.92 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  29.06 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  27.14 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  29.06 
 
 		 261 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  33.05 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  29.17 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  29.06 
 
 		 268 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0049  protein of unknown function DUF218  26.09 
 
 		 185 aa  42  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.291592  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2273  protein of unknown function DUF218  29.91 
 
 		 188 aa  42  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  27.27 
 
 		 251 aa  42  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  36.67 
 
 		 262 aa  42  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  26.12 
 
 		 262 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  25.95 
 
 		 206 aa  41.6  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>