25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2273 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2273  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0049  protein of unknown function DUF218  40.57 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.291592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1708  hypothetical protein  44.3 
 
 		 190 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3967  hypothetical protein  33.92 
 
 		 216 aa  88.2  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0763  hypothetical protein  36.76 
 
 		 182 aa  87.8  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0764  hypothetical protein  35.42 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0330031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1575  hypothetical protein  38.17 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1127  hypothetical protein  30.92 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16750  hypothetical protein  28.72 
 
 		 243 aa  53.9  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  28.87 
 
 		 251 aa  52  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  29.71 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  32.37 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0901  protein of unknown function DUF218  30.12 
 
 		 201 aa  45.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  26.09 
 
 		 225 aa  44.7  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  30.77 
 
 		 300 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  28.17 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  30.15 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  26.43 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  26.09 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  30.71 
 
 		 250 aa  43.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  27.45 
 
 		 264 aa  42.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  25 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  26.01 
 
 		 208 aa  42  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0483  hypothetical protein  30.83 
 
 		 259 aa  42  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  29.91 
 
 		 218 aa  42  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>