14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1575 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1575  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0763  hypothetical protein  56.69 
 
 		 182 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3967  hypothetical protein  49.13 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0764  hypothetical protein  47.74 
 
 		 212 aa  148  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0330031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1708  hypothetical protein  38.06 
 
 		 190 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0049  protein of unknown function DUF218  32.35 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.291592  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2273  protein of unknown function DUF218  38.17 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0483  hypothetical protein  34.96 
 
 		 259 aa  46.2  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1127  hypothetical protein  34.13 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  31.71 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  30.77 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  33.14 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  24.11 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  26.42 
 
 		 246 aa  42.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>